RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000180802.1

Gm20109-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20109, Length 671 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Gm156Q58A37 223 aa37.55■■■■□ 3.6
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Abcc1O35379 1528 aa37.54■■■■□ 3.6
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa37.51■■■■□ 3.59
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Zeb1Q64318 1117 aa37.49■■■■□ 3.59
Gm20109-201ENSMUST00000180802 CadpsQ80TJ1 1355 aa37.4■■■■□ 3.58
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa37.39■■■■□ 3.58
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa37.39■■■■□ 3.58
Gm20109-201ENSMUST00000180802 PtprtQ99M80 1454 aa37.39■■■■□ 3.58
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Abcc2Q8VI47 1543 aa37.36■■■■□ 3.57
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Chd1P40201 1711 aa37.36■■■■□ 3.57
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Abca16E9PWJ7 1678 aa37.36■■■■□ 3.57
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Arhgap27A2AB59 869 aa37.32■■■■□ 3.56
Gm20109-201ENSMUST00000180802 PxdnQ3UQ28 1475 aa37.32■■■■□ 3.56
Gm20109-201ENSMUST00000180802 WizO88286 1684 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
Gm20109-201ENSMUST00000180802 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa37.3■■■■□ 3.56
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa37.3■■■■□ 3.56
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Neo1P97798 1493 aa37.27■■■■□ 3.56
Gm20109-201ENSMUST00000180802 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.55
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Map3k4O08648 1597 aa37.25■■■■□ 3.55
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Soga1E1U8D0 1418 aa37.25■■■■□ 3.55
Gm20109-201ENSMUST00000180802 BC005561E9Q5E2 1589 aa37.25■■■■□ 3.55
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Adamts12Q811B3 1600 aa37.25■■■■□ 3.55
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa37.24■■■■□ 3.55
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Npm2Q80W85 207 aa37.22■■■■□ 3.55
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Pprc1Q6NZN1 1644 aa37.19■■■■□ 3.54
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Gm14025A2AP89 1413 aa37.12■■■■□ 3.53
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.52
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Slx4Q6P1D7 1565 aa37.03■■■■□ 3.52
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Carmil1Q6EDY6 1374 aa37.03■■■■□ 3.52
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Setbp1Q9Z180 1582 aa37.01■■■■□ 3.52
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Rpap1Q80TE0 1409 aa36.98■■■■□ 3.51
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Map3k1P53349 1493 aa36.96■■■■□ 3.51
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Arhgap35Q91YM2 1499 aa36.94■■■■□ 3.5
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa36.93■■■■□ 3.5
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
Gm20109-201ENSMUST00000180802 AI481877A2ALV5 1481 aa36.91■■■■□ 3.5
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Jph4Q80WT0 628 aa36.86■■■■□ 3.49
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Gab3Q8BSM5 595 aa36.85■■■■□ 3.49
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Ak9G3UYQ4 1894 aa36.82■■■■□ 3.48
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Abca5Q8K448 1642 aa36.79■■■■□ 3.48
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa36.77■■■■□ 3.48
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa36.76■■■■□ 3.48
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
Gm20109-201ENSMUST00000180802 WrnO09053 1401 aa36.67■■■■□ 3.46
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Cux1P53564 1515 aa36.65■■■■□ 3.46
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Clip1Q922J3 1391 aa36.61■■■■□ 3.45
Gm20109-201ENSMUST00000180802 HrcG5E8J6 738 aa36.6■■■■□ 3.45
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Cep162Q6ZQ06 1403 aa36.58■■■■□ 3.45
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Kdm5bQ80Y84 1544 aa36.49■■■■□ 3.43
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Arid3cA6PWV5 409 aa36.47■■■■□ 3.43
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Igf1rQ60751 1373 aa36.47■■■■□ 3.43
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa36.47■■■■□ 3.43
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Fyco1Q8VDC1 1437 aa36.46■■■■□ 3.43
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Ttc37F8VPK0 1563 aa36.43■■■■□ 3.42
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Myt1lP97500 1187 aa36.42■■■■□ 3.42
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Znf608Q56A10 1511 aa36.41■■■■□ 3.42
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa36.35■■■■□ 3.41
Gm20109-201ENSMUST00000180802 AdgbG3UZ78 1657 aa36.34■■■■□ 3.41
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa36.34■■■■□ 3.41
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Depdc5P61460 1591 aa36.32■■■■□ 3.4
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Wdr7Q920I9 1489 aa36.3■■■■□ 3.4
Gm20109-201ENSMUST00000180802 NhsB1AV60 1647 aa36.26■■■■□ 3.4
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Cul7Q8VE73 1689 aa36.26■■■■□ 3.4
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa36.24■■■■□ 3.39
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Ankrd26Q811D2 1581 aa36.23■■■■□ 3.39
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Zfyve16Q80U44 1528 aa36.21■■■■□ 3.39
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Atp10dQ8K2X1 1416 aa36.15■■■■□ 3.38
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Mroh2aD3Z750 1679 aa36.11■■■■□ 3.37
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Aebp1Q640N1 1128 aa36.08■■■■□ 3.37
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Gcc2Q8CHG3 1679 aa36.06■■■■□ 3.36
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Arhgef11Q68FM7 1552 aa36.05■■■■□ 3.36
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Fndc1E9Q043 1732 aa36.05■■■■□ 3.36
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa36.04■■■■□ 3.36
Gm20109-201ENSMUST00000180802 BlmO88700 1416 aa35.99■■■■□ 3.35
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Ncoa2Q61026 1462 aa35.99■■■■□ 3.35
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Kif27Q7M6Z4 1394 aa35.97■■■■□ 3.35
Gm20109-201ENSMUST00000180802 AglF8VPN4 1532 aa35.97■■■■□ 3.35
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa35.96■■■■□ 3.35
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Fancd2Q80V62 1450 aa35.96■■■■□ 3.35
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa35.94■■■■□ 3.34
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Abca8bQ8K440 1620 aa35.9■■■■□ 3.34
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Dnajc5gQ8C632 165 aa35.89■■■■□ 3.34
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Setd5Q5XJV7 1441 aa35.89■■■■□ 3.34
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Arap1Q4LDD4 1452 aa35.88■■■■□ 3.33
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Plppr3Q7TPB0 716 aa35.86■■■■□ 3.33
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Magi1Q6RHR9 1471 aa35.86■■■■□ 3.33
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Erich3F6QRE9 1637 aa35.85■■■■□ 3.33
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Alpk3Q924C5 1678 aa35.84■■■■□ 3.33
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa35.79■■■■□ 3.32
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Prex2Q3LAC4 1598 aa35.76■■■■□ 3.32
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Pcf11G3X9Z4 1553 aa35.75■■■■□ 3.31
Gm20109-201ENSMUST00000180802 A2mQ6GQT1 1474 aa35.74■■■■□ 3.31
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Ncoa3O09000 1398 aa35.72■■■■□ 3.31
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Eea1Q8BL66 1411 aa35.71■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 136.9 ms