RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171112.7

Ube2f-202, Transcript of NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2f, Length 1,547 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Fgd6Q69ZL1 1399 aa41.99■■■■■ 4.31
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Map3k1P53349 1493 aa41.9■■■■■ 4.3
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Col17a1Q07563 1470 aa41.88■■■■■ 4.29
Ube2f-202ENSMUST00000171112 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Carmil1Q6EDY6 1374 aa41.86■■■■■ 4.29
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Cep162Q6ZQ06 1403 aa41.85■■■■■ 4.29
Ube2f-202ENSMUST00000171112 WizO88286 1684 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Abca16E9PWJ7 1678 aa41.82■■■■■ 4.29
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Adamts12Q811B3 1600 aa41.81■■■■■ 4.28
Ube2f-202ENSMUST00000171112 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa41.81■■■■■ 4.28
Ube2f-202ENSMUST00000171112 PxdnQ3UQ28 1475 aa41.77■■■■■ 4.28
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Abcc2Q8VI47 1543 aa41.75■■■■■ 4.27
Ube2f-202ENSMUST00000171112 AknaQ80VW7 1404 aa41.73■■■■■ 4.27
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Arhgap27A2AB59 869 aa41.67■■■■■ 4.26
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Abcc1O35379 1528 aa41.61■■■■■ 4.25
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Clip1Q922J3 1391 aa41.6■■■■■ 4.25
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Map3k4O08648 1597 aa41.6■■■■■ 4.25
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
Ube2f-202ENSMUST00000171112 CadpsQ80TJ1 1355 aa41.58■■■■■ 4.25
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Myt1lP97500 1187 aa41.56■■■■■ 4.24
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa41.53■■■■■ 4.24
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Rpap1Q80TE0 1409 aa41.52■■■■■ 4.24
Ube2f-202ENSMUST00000171112 BC005561E9Q5E2 1589 aa41.52■■■■■ 4.24
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Neo1P97798 1493 aa41.5■■■■■ 4.23
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa41.5■■■■■ 4.23
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Cux1P53564 1515 aa41.47■■■■■ 4.23
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Chd1P40201 1711 aa41.46■■■■■ 4.23
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Cep170Q6A065 1588 aa41.44■■■■■ 4.22
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Soga1E1U8D0 1418 aa41.42■■■■■ 4.22
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Slx4Q6P1D7 1565 aa41.4■■■■■ 4.22
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Abca5Q8K448 1642 aa41.39■■■■■ 4.22
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.21
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Adgrl3Q80TS3 1537 aa41.32■■■■■ 4.2
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Gm14025A2AP89 1413 aa41.29■■■■■ 4.2
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Fyco1Q8VDC1 1437 aa41.29■■■■■ 4.2
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Gm156Q58A37 223 aa41.24■■■■■ 4.19
Ube2f-202ENSMUST00000171112 PtprtQ99M80 1454 aa41.24■■■■■ 4.19
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Ankrd26Q811D2 1581 aa41.19■■■■■ 4.18
Ube2f-202ENSMUST00000171112 WrnO09053 1401 aa41.17■■■■■ 4.18
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Jph4Q80WT0 628 aa41.15■■■■■ 4.18
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa40.93■■■■■ 4.14
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Setd5Q5XJV7 1441 aa40.93■■■■■ 4.14
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Erich3F6QRE9 1637 aa40.91■■■■■ 4.14
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.14
Ube2f-202ENSMUST00000171112 AI481877A2ALV5 1481 aa40.88■■■■■ 4.14
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Aebp1Q640N1 1128 aa40.87■■■■■ 4.13
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Eea1Q8BL66 1411 aa40.85■■■■■ 4.13
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Pprc1Q6NZN1 1644 aa40.84■■■■■ 4.13
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa40.83■■■■■ 4.13
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Setbp1Q9Z180 1582 aa40.81■■■■■ 4.12
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa40.79■■■■■ 4.12
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Kdm5bQ80Y84 1544 aa40.75■■■■■ 4.11
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa40.73■■■■■ 4.11
Ube2f-202ENSMUST00000171112 BlmO88700 1416 aa40.73■■■■■ 4.11
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Pcf11G3X9Z4 1553 aa40.73■■■■■ 4.11
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa40.71■■■■■ 4.11
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa40.7■■■■■ 4.11
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Kif27Q7M6Z4 1394 aa40.67■■■■■ 4.1
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Ak9G3UYQ4 1894 aa40.65■■■■■ 4.1
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa40.65■■■■■ 4.1
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Arap1Q4LDD4 1452 aa40.64■■■■■ 4.1
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Igf1rQ60751 1373 aa40.62■■■■■ 4.09
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Mroh2aD3Z750 1679 aa40.56■■■■■ 4.08
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Cul7Q8VE73 1689 aa40.56■■■■■ 4.08
Ube2f-202ENSMUST00000171112 NhsB1AV60 1647 aa40.54■■■■■ 4.08
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa40.54■■■■■ 4.08
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Ncoa2Q61026 1462 aa40.53■■■■■ 4.08
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Znf608Q56A10 1511 aa40.49■■■■■ 4.07
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Gcc2Q8CHG3 1679 aa40.45■■■■■ 4.07
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Wdr7Q920I9 1489 aa40.44■■■■■ 4.06
Ube2f-202ENSMUST00000171112 CntlnA2AM05 1397 aa40.43■■■■■ 4.06
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Arid3cA6PWV5 409 aa40.42■■■■■ 4.06
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa40.42■■■■■ 4.06
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa40.42■■■■■ 4.06
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Arhgef11Q68FM7 1552 aa40.42■■■■■ 4.06
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Magi1Q6RHR9 1471 aa40.37■■■■■ 4.05
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Fancd2Q80V62 1450 aa40.37■■■■■ 4.05
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Atp10dQ8K2X1 1416 aa40.34■■■■■ 4.05
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Ncoa3O09000 1398 aa40.31■■■■■ 4.04
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa40.3■■■■■ 4.04
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Mug1P28665 1476 aa40.25■■■■■ 4.03
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa40.25■■■■■ 4.03
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Prex2Q3LAC4 1598 aa40.24■■■■■ 4.03
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Naip1Q9QWK5 1403 aa40.24■■■■■ 4.03
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Peg3Q3URU2 1571 aa40.24■■■■■ 4.03
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Lmod2Q3UHZ5 550 aa40.21■■■■■ 4.03
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Tiam1Q60610 1591 aa40.2■■■■■ 4.03
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Ttc37F8VPK0 1563 aa40.2■■■■■ 4.03
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Fam163aQ8CAA5 168 aa40.19■■■■■ 4.02
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Abca8bQ8K440 1620 aa40.18■■■■■ 4.02
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Depdc5P61460 1591 aa40.14■■■■■ 4.02
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa40.13■■■■■ 4.01
Ube2f-202ENSMUST00000171112 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.2 ms