RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000152170.7

Pdss1-207, Transcript of Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdss1, Length 1,538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cep170Q6A065 1588 aa35.95■■■■□ 3.35
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Pdss1-207ENSMUST00000152170 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa35.91■■■■□ 3.34
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Npm2Q80W85 207 aa35.89■■■■□ 3.34
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gm156Q58A37 223 aa35.88■■■■□ 3.33
Pdss1-207ENSMUST00000152170 CadpsQ80TJ1 1355 aa35.87■■■■□ 3.33
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Arhgap27A2AB59 869 aa35.8■■■■□ 3.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Abca16E9PWJ7 1678 aa35.79■■■■□ 3.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa35.79■■■■□ 3.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Abcc2Q8VI47 1543 aa35.79■■■■□ 3.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 WizO88286 1684 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 PxdnQ3UQ28 1475 aa35.77■■■■□ 3.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Adamts12Q811B3 1600 aa35.76■■■■□ 3.31
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa35.75■■■■□ 3.31
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Chd1P40201 1711 aa35.72■■■■□ 3.31
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Map3k4O08648 1597 aa35.71■■■■□ 3.31
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Soga1E1U8D0 1418 aa35.7■■■■□ 3.31
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Neo1P97798 1493 aa35.69■■■■□ 3.3
Pdss1-207ENSMUST00000152170 PtprtQ99M80 1454 aa35.68■■■■□ 3.3
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa35.67■■■■□ 3.3
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Carmil1Q6EDY6 1374 aa35.65■■■■□ 3.3
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa35.64■■■■□ 3.3
Pdss1-207ENSMUST00000152170 BC005561E9Q5E2 1589 aa35.63■■■■□ 3.3
Pdss1-207ENSMUST00000152170 HrcG5E8J6 738 aa35.61■■■■□ 3.29
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Map3k1P53349 1493 aa35.59■■■■□ 3.29
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gm14025A2AP89 1413 aa35.59■■■■□ 3.29
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gab3Q8BSM5 595 aa35.57■■■■□ 3.29
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Arhgap35Q91YM2 1499 aa35.57■■■■□ 3.28
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa35.53■■■■□ 3.28
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Slx4Q6P1D7 1565 aa35.51■■■■□ 3.28
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rpap1Q80TE0 1409 aa35.51■■■■□ 3.28
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa35.48■■■■□ 3.27
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Pprc1Q6NZN1 1644 aa35.47■■■■□ 3.27
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Jph4Q80WT0 628 aa35.39■■■■□ 3.26
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.26
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Setbp1Q9Z180 1582 aa35.38■■■■□ 3.25
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
Pdss1-207ENSMUST00000152170 AI481877A2ALV5 1481 aa35.35■■■■□ 3.25
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Abca5Q8K448 1642 aa35.33■■■■□ 3.25
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Clip1Q922J3 1391 aa35.31■■■■□ 3.24
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cep162Q6ZQ06 1403 aa35.31■■■■□ 3.24
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cux1P53564 1515 aa35.23■■■■□ 3.23
Pdss1-207ENSMUST00000152170 WrnO09053 1401 aa35.23■■■■□ 3.23
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ak9G3UYQ4 1894 aa35.17■■■■□ 3.22
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa35.15■■■■□ 3.22
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa35.14■■■■□ 3.22
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Myt1lP97500 1187 aa35.13■■■■□ 3.21
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Fyco1Q8VDC1 1437 aa35.11■■■■□ 3.21
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Igf1rQ60751 1373 aa35.03■■■■□ 3.2
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Kdm5bQ80Y84 1544 aa35.01■■■■□ 3.2
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa34.91■■■■□ 3.18
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa34.9■■■■□ 3.18
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Arid3cA6PWV5 409 aa34.9■■■■□ 3.18
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ankrd26Q811D2 1581 aa34.86■■■■□ 3.17
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Znf608Q56A10 1511 aa34.82■■■■□ 3.17
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa34.81■■■■□ 3.16
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ttc37F8VPK0 1563 aa34.8■■■■□ 3.16
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Wdr7Q920I9 1489 aa34.8■■■■□ 3.16
Pdss1-207ENSMUST00000152170 NhsB1AV60 1647 aa34.77■■■■□ 3.16
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Aebp1Q640N1 1128 aa34.76■■■■□ 3.15
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cul7Q8VE73 1689 aa34.72■■■■□ 3.15
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa34.72■■■■□ 3.15
Pdss1-207ENSMUST00000152170 AdgbG3UZ78 1657 aa34.71■■■■□ 3.15
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Depdc5P61460 1591 aa34.69■■■■□ 3.14
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Atp10dQ8K2X1 1416 aa34.67■■■■□ 3.14
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Zfyve16Q80U44 1528 aa34.65■■■■□ 3.14
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Setd5Q5XJV7 1441 aa34.64■■■■□ 3.14
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Mroh2aD3Z750 1679 aa34.63■■■■□ 3.13
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Kif27Q7M6Z4 1394 aa34.63■■■■□ 3.13
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa34.63■■■■□ 3.13
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ncoa2Q61026 1462 aa34.62■■■■□ 3.13
Pdss1-207ENSMUST00000152170 BlmO88700 1416 aa34.61■■■■□ 3.13
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gcc2Q8CHG3 1679 aa34.58■■■■□ 3.13
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Fancd2Q80V62 1450 aa34.55■■■■□ 3.12
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Erich3F6QRE9 1637 aa34.54■■■■□ 3.12
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa34.52■■■■□ 3.12
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Eea1Q8BL66 1411 aa34.5■■■■□ 3.11
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Arap1Q4LDD4 1452 aa34.48■■■■□ 3.11
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Magi1Q6RHR9 1471 aa34.47■■■■□ 3.11
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa34.45■■■■□ 3.11
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Arhgef11Q68FM7 1552 aa34.44■■■■□ 3.1
Pdss1-207ENSMUST00000152170 AglF8VPN4 1532 aa34.44■■■■□ 3.1
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Abca8bQ8K440 1620 aa34.44■■■■□ 3.1
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Fndc1E9Q043 1732 aa34.43■■■■□ 3.1
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Pcf11G3X9Z4 1553 aa34.42■■■■□ 3.1
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Fam163aQ8CAA5 168 aa34.35■■■■□ 3.09
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ncoa3O09000 1398 aa34.34■■■■□ 3.09
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Prex2Q3LAC4 1598 aa34.32■■■■□ 3.08
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa34.26■■■■□ 3.07
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Mug1P28665 1476 aa34.26■■■■□ 3.07
Pdss1-207ENSMUST00000152170 A2mQ6GQT1 1474 aa34.25■■■■□ 3.07
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
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