RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000124246.3

Gt(ROSA)26Sor-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gt(ROSA)26Sor, Length 1,181 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pla2r1Q62028 1487 aa36,69■■■■□ 3,46
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP36,69■■■■□ 3,46
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Chd1P40201 1711 aa36,68■■■■□ 3,46
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa36,66■■■■□ 3,46
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP36,64■■■■□ 3,46
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 SynmQ70IV5 1561 aa36,63■■■■□ 3,45
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 CadpsQ80TJ1 1355 aa36,6■■■■□ 3,45
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Shroom4Q1W617 1475 aa36,6■■■■□ 3,45
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pprc1Q6NZN1 1644 aa36,57■■■■□ 3,44
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa36,55■■■■□ 3,44
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP36,51■■■■□ 3,43
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Soga1E1U8D0 1418 aa36,45■■■■□ 3,43
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Abca16E9PWJ7 1678 aa36,39■■■■□ 3,42
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Setbp1Q9Z180 1582 aa36,36■■■■□ 3,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Zeb1Q64318 1117 aa36,35■■■■□ 3,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Neo1P97798 1493 aa36,35■■■■□ 3,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Abcc2Q8VI47 1543 aa36,34■■■■□ 3,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arhgap27A2AB59 869 aa36,34■■■■□ 3,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 WizO88286 1684 aaKnown RBP36,32■■■■□ 3,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 BC005561E9Q5E2 1589 aa36,32■■■■□ 3,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Chic1Q8CBW7 227 aa36,32■■■■□ 3,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa36,32■■■■□ 3,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Map3k4O08648 1597 aa36,31■■■■□ 3,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ak9G3UYQ4 1894 aa36,26■■■■□ 3,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm14025A2AP89 1413 aa36,26■■■■□ 3,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 PxdnQ3UQ28 1475 aa36,25■■■■□ 3,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Adamts12Q811B3 1600 aa36,23■■■■□ 3,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa36,17■■■■□ 3,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP36,17■■■■□ 3,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 AI481877A2ALV5 1481 aa36,17■■■■□ 3,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa36,1■■■■□ 3,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP36,08■■■■□ 3,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP36,08■■■■□ 3,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Slx4Q6P1D7 1565 aa36,06■■■■□ 3,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa35,95■■■■□ 3,35
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Npm2Q80W85 207 aa35,92■■■■□ 3,34
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Jph4Q80WT0 628 aa35,92■■■■□ 3,34
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rpap1Q80TE0 1409 aa35,91■■■■□ 3,34
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP35,85■■■■□ 3,33
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa35,82■■■■□ 3,32
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Carmil1Q6EDY6 1374 aa35,82■■■■□ 3,32
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 AdgbG3UZ78 1657 aa35,81■■■■□ 3,32
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Map3k1P53349 1493 aa35,79■■■■□ 3,32
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ttc37F8VPK0 1563 aa35,78■■■■□ 3,32
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa35,74■■■■□ 3,31
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP35,73■■■■□ 3,31
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Abca5Q8K448 1642 aa35,72■■■■□ 3,31
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa35,71■■■■□ 3,31
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Igf1rQ60751 1373 aa35,67■■■■□ 3,3
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP35,66■■■■□ 3,3
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arid3cA6PWV5 409 aa35,66■■■■□ 3,3
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP35,65■■■■□ 3,3
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa35,62■■■■□ 3,29
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 WrnO09053 1401 aa35,61■■■■□ 3,29
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Depdc5P61460 1591 aa35,59■■■■□ 3,29
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arhgef11Q68FM7 1552 aa35,59■■■■□ 3,29
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kdm5bQ80Y84 1544 aa35,57■■■■□ 3,29
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arhgap35Q91YM2 1499 aa35,57■■■■□ 3,28
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Znf608Q56A10 1511 aa35,5■■■■□ 3,27
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Zfyve16Q80U44 1528 aa35,5■■■■□ 3,27
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Wdr7Q920I9 1489 aa35,44■■■■□ 3,26
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Alpk3Q924C5 1678 aa35,43■■■■□ 3,26
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fndc1E9Q043 1732 aa35,4■■■■□ 3,26
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cux1P53564 1515 aa35,4■■■■□ 3,26
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cul7Q8VE73 1689 aa35,38■■■■□ 3,25
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 NhsB1AV60 1647 aa35,35■■■■□ 3,25
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Clip1Q922J3 1391 aa35,33■■■■□ 3,25
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa35,29■■■■□ 3,24
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Plppr3Q7TPB0 716 aa35,28■■■■□ 3,24
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gab3Q8BSM5 595 aa35,27■■■■□ 3,24
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fyco1Q8VDC1 1437 aa35,26■■■■□ 3,24
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa35,24■■■■□ 3,23
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Atp10dQ8K2X1 1416 aa35,22■■■■□ 3,23
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 AglF8VPN4 1532 aa35,22■■■■□ 3,23
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dnajc5gQ8C632 165 aa35,16■■■■□ 3,22
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gcc2Q8CHG3 1679 aa35,13■■■■□ 3,21
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cep162Q6ZQ06 1403 aa35,11■■■■□ 3,21
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mroh2aD3Z750 1679 aa35,08■■■■□ 3,21
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa35,03■■■■□ 3,2
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Myt1lP97500 1187 aa35,02■■■■□ 3,2
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Abca8bQ8K440 1620 aa35■■■■□ 3,19
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rnf17Q99MV7 1640 aa34,99■■■■□ 3,19
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP34,97■■■■□ 3,19
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa34,96■■■■□ 3,19
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ncoa2Q61026 1462 aa34,95■■■■□ 3,19
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fancd2Q80V62 1450 aa34,95■■■■□ 3,19
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 BlmO88700 1416 aa34,91■■■■□ 3,18
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ankrd26Q811D2 1581 aa34,91■■■■□ 3,18
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 A2mQ6GQT1 1474 aa34,9■■■■□ 3,18
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa34,85■■■■□ 3,17
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Aebp1Q640N1 1128 aa34,85■■■■□ 3,17
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kif27Q7M6Z4 1394 aa34,82■■■■□ 3,16
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arap1Q4LDD4 1452 aa34,8■■■■□ 3,16
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Magi1Q6RHR9 1471 aa34,78■■■■□ 3,16
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Brwd3A2AHJ4 1799 aa34,78■■■■□ 3,16
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 HrcG5E8J6 738 aa34,76■■■■□ 3,16
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cyb5rlB1AS42 316 aa34,74■■■■□ 3,15
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Naip2Q9QUK4 1447 aa34,71■■■■□ 3,15
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Prex2Q3LAC4 1598 aa34,7■■■■□ 3,15
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa34,67■■■■□ 3,14
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