RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049697.4

Cldn8-201, Transcript of Claudin-8, mousemouse

APPRIS P1 BASIC

Gene Cldn8, Length 2,356 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Tight Junction .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8-201ENSMUST00000049697 WizO88286 1684 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Cldn8-201ENSMUST00000049697 HrcG5E8J6 738 aa15.95■□□□□ 0.14
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Abca16E9PWJ7 1678 aa15.95■□□□□ 0.14
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Gpatch8A2A6A1 1505 aa15.94■□□□□ 0.14
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Arhgap27A2AB59 869 aa15.94■□□□□ 0.14
Cldn8-201ENSMUST00000049697 PxdnQ3UQ28 1475 aa15.93■□□□□ 0.14
Cldn8-201ENSMUST00000049697 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Cldn8-201ENSMUST00000049697 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa15.91■□□□□ 0.14
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Abcc1O35379 1528 aa15.9■□□□□ 0.14
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Abcc2Q8VI47 1543 aa15.9■□□□□ 0.14
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa15.9■□□□□ 0.14
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Cep170Q6A065 1588 aa15.89■□□□□ 0.13
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Arhgap35Q91YM2 1499 aa15.89■□□□□ 0.13
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Chd1P40201 1711 aa15.88■□□□□ 0.13
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Adamts12Q811B3 1600 aa15.87■□□□□ 0.13
Cldn8-201ENSMUST00000049697 BC005561E9Q5E2 1589 aa15.87■□□□□ 0.13
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Neo1P97798 1493 aa15.86■□□□□ 0.13
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Adgrl3Q80TS3 1537 aa15.86■□□□□ 0.13
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Myt1lP97500 1187 aa15.85■□□□□ 0.13
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Rpap1Q80TE0 1409 aa15.84■□□□□ 0.13
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Carmil1Q6EDY6 1374 aa15.84■□□□□ 0.13
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Gm156Q58A37 223 aa15.83■□□□□ 0.12
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Map3k4O08648 1597 aa15.82■□□□□ 0.12
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
Cldn8-201ENSMUST00000049697 CadpsQ80TJ1 1355 aa15.82■□□□□ 0.12
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Soga1E1U8D0 1418 aa15.81■□□□□ 0.12
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa15.81■□□□□ 0.12
Cldn8-201ENSMUST00000049697 PtprtQ99M80 1454 aa15.8■□□□□ 0.12
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Cep162Q6ZQ06 1403 aa15.8■□□□□ 0.12
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa15.78■□□□□ 0.12
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Map3k1P53349 1493 aa15.78■□□□□ 0.12
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Gm14025A2AP89 1413 aa15.75■□□□□ 0.11
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Cux1P53564 1515 aa15.75■□□□□ 0.11
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Slx4Q6P1D7 1565 aa15.75■□□□□ 0.11
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa15.74■□□□□ 0.11
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Clip1Q922J3 1391 aa15.74■□□□□ 0.11
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa15.73■□□□□ 0.11
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Abca5Q8K448 1642 aa15.7■□□□□ 0.1
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Jph4Q80WT0 628 aa15.68■□□□□ 0.1
Cldn8-201ENSMUST00000049697 WrnO09053 1401 aa15.68■□□□□ 0.1
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa15.68■□□□□ 0.1
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Pprc1Q6NZN1 1644 aa15.67■□□□□ 0.1
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa15.65■□□□□ 0.1
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Fyco1Q8VDC1 1437 aa15.62■□□□□ 0.09
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Ak9G3UYQ4 1894 aa15.61■□□□□ 0.09
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Ankrd26Q811D2 1581 aa15.6■□□□□ 0.09
Cldn8-201ENSMUST00000049697 AI481877A2ALV5 1481 aa15.6■□□□□ 0.09
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Setbp1Q9Z180 1582 aa15.59■□□□□ 0.09
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa15.57■□□□□ 0.08
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa15.56■□□□□ 0.08
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Arid3cA6PWV5 409 aa15.54■□□□□ 0.08
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa15.52■□□□□ 0.07
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Znf608Q56A10 1511 aa15.52■□□□□ 0.07
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Setd5Q5XJV7 1441 aa15.5■□□□□ 0.07
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Aebp1Q640N1 1128 aa15.49■□□□□ 0.07
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa15.48■□□□□ 0.07
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Kdm5bQ80Y84 1544 aa15.48■□□□□ 0.07
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Cul7Q8VE73 1689 aa15.48■□□□□ 0.07
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa15.47■□□□□ 0.07
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Mroh2aD3Z750 1679 aa15.45■□□□□ 0.06
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Erich3F6QRE9 1637 aa15.45■□□□□ 0.06
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Pcf11G3X9Z4 1553 aa15.43■□□□□ 0.06
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Kif27Q7M6Z4 1394 aa15.43■□□□□ 0.06
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa15.43■□□□□ 0.06
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Igf1rQ60751 1373 aa15.43■□□□□ 0.06
Cldn8-201ENSMUST00000049697 NhsB1AV60 1647 aa15.42■□□□□ 0.06
Cldn8-201ENSMUST00000049697 BlmO88700 1416 aa15.42■□□□□ 0.06
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Eea1Q8BL66 1411 aa15.41■□□□□ 0.06
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Wdr7Q920I9 1489 aa15.41■□□□□ 0.06
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Depdc5P61460 1591 aa15.4■□□□□ 0.06
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Gcc2Q8CHG3 1679 aa15.4■□□□□ 0.06
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Atp10dQ8K2X1 1416 aa15.38■□□□□ 0.05
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Ttc37F8VPK0 1563 aa15.38■□□□□ 0.05
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Arap1Q4LDD4 1452 aa15.36■□□□□ 0.05
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Ncoa2Q61026 1462 aa15.36■□□□□ 0.05
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Arhgef11Q68FM7 1552 aa15.35■□□□□ 0.05
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Lmod2Q3UHZ5 550 aa15.34■□□□□ 0.05
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Prex2Q3LAC4 1598 aa15.33■□□□□ 0.04
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa15.33■□□□□ 0.04
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Fancd2Q80V62 1450 aa15.33■□□□□ 0.04
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Magi1Q6RHR9 1471 aa15.32■□□□□ 0.04
Cldn8-201ENSMUST00000049697 AdgbG3UZ78 1657 aa15.32■□□□□ 0.04
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Plppr3Q7TPB0 716 aa15.31■□□□□ 0.04
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Ncoa3O09000 1398 aa15.3■□□□□ 0.04
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Zfyve16Q80U44 1528 aa15.28■□□□□ 0.04
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Abca8bQ8K440 1620 aa15.28■□□□□ 0.04
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Mug1P28665 1476 aa15.26■□□□□ 0.03
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa15.26■□□□□ 0.03
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Fndc1E9Q043 1732 aa15.25■□□□□ 0.03
Cldn8-201ENSMUST00000049697 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa15.24■□□□□ 0.03
Cldn8-201ENSMUST00000049697 CntlnA2AM05 1397 aa15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27 ms