RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rusc2Q80U22 1514 aa28.76■■■□□ 2.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa28.66■■■□□ 2.18
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Erich3F6QRE9 1637 aa28.66■■■□□ 2.18
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ankrd26Q811D2 1581 aa28.66■■■□□ 2.18
Cbx1-201ENSMUST00000018810 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cux1P53564 1515 aa28.63■■■□□ 2.17
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dnajc5P60904 198 aa28.61■■■□□ 2.17
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adamts12Q811B3 1600 aa28.61■■■□□ 2.17
Cbx1-201ENSMUST00000018810 WizO88286 1684 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Eea1Q8BL66 1411 aa28.57■■■□□ 2.16
Cbx1-201ENSMUST00000018810 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa28.55■■■□□ 2.16
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abca16E9PWJ7 1678 aa28.55■■■□□ 2.16
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rpap1Q80TE0 1409 aa28.53■■■□□ 2.16
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fyco1Q8VDC1 1437 aa28.52■■■□□ 2.16
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abca5Q8K448 1642 aa28.5■■■□□ 2.15
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Setd5Q5XJV7 1441 aa28.49■■■□□ 2.15
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arap1Q4LDD4 1452 aa28.46■■■□□ 2.15
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pcf11G3X9Z4 1553 aa28.42■■■□□ 2.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CadpsQ80TJ1 1355 aa28.41■■■□□ 2.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa28.41■■■□□ 2.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PxdnQ3UQ28 1475 aa28.41■■■□□ 2.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa28.4■■■□□ 2.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa28.39■■■□□ 2.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abcc2Q8VI47 1543 aa28.35■■■□□ 2.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Soga1E1U8D0 1418 aa28.34■■■□□ 2.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Map3k4O08648 1597 aa28.26■■■□□ 2.11
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tiam1Q60610 1591 aa28.25■■■□□ 2.11
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
Cbx1-201ENSMUST00000018810 BlmO88700 1416 aa28.22■■■□□ 2.11
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Peg3Q3URU2 1571 aa28.22■■■□□ 2.11
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Shroom2A2ALU4 1481 aa28.19■■■□□ 2.1
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa28.19■■■□□ 2.1
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
Cbx1-201ENSMUST00000018810 BC005561E9Q5E2 1589 aa28.17■■■□□ 2.1
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fgd6Q69ZL1 1399 aa28.17■■■□□ 2.1
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slx4Q6P1D7 1565 aa28.16■■■□□ 2.1
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CntlnA2AM05 1397 aa28.14■■■□□ 2.1
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arhgap27A2AB59 869 aa28.13■■■□□ 2.09
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Aebp1Q640N1 1128 aa28.13■■■□□ 2.09
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Naip1Q9QWK5 1403 aa28.12■■■□□ 2.09
Cbx1-201ENSMUST00000018810 WrnO09053 1401 aa28.07■■■□□ 2.08
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa28.07■■■□□ 2.08
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Neo1P97798 1493 aa28.03■■■□□ 2.08
Cbx1-201ENSMUST00000018810 AknaQ80VW7 1404 aa28.02■■■□□ 2.08
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kif27Q7M6Z4 1394 aa27.98■■■□□ 2.07
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa27.98■■■□□ 2.07
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Chd1P40201 1711 aa27.97■■■□□ 2.07
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa27.95■■■□□ 2.06
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abcc1O35379 1528 aa27.93■■■□□ 2.06
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Col17a1Q07563 1470 aa27.86■■■□□ 2.05
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa27.84■■■□□ 2.05
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm14025A2AP89 1413 aa27.84■■■□□ 2.05
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa27.82■■■□□ 2.04
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arhgef11Q68FM7 1552 aa27.82■■■□□ 2.04
Cbx1-201ENSMUST00000018810 UbtfP25976 765 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ncoa2Q61026 1462 aa27.8■■■□□ 2.04
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lmod2Q3UHZ5 550 aa27.79■■■□□ 2.04
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Jph4Q80WT0 628 aa27.78■■■□□ 2.04
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mroh2aD3Z750 1679 aa27.78■■■□□ 2.04
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gcc2Q8CHG3 1679 aa27.74■■■□□ 2.03
Cbx1-201ENSMUST00000018810 NexmifQ5DTT1 1515 aa27.73■■■□□ 2.03
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa27.73■■■□□ 2.03
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa27.73■■■□□ 2.03
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mug1P28665 1476 aa27.72■■■□□ 2.03
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cul7Q8VE73 1689 aa27.67■■■□□ 2.02
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ncoa3O09000 1398 aa27.67■■■□□ 2.02
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Magi1Q6RHR9 1471 aa27.66■■■□□ 2.02
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa27.66■■■□□ 2.02
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kdm5bQ80Y84 1544 aa27.64■■■□□ 2.02
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa27.63■■■□□ 2.01
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa27.62■■■□□ 2.01
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Prex2Q3LAC4 1598 aa27.59■■■□□ 2.01
Cbx1-201ENSMUST00000018810 NhsB1AV60 1647 aa27.58■■■□□ 2.01
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cep170Q6A065 1588 aa27.58■■■□□ 2.01
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccnb3Q810T2 1396 aa27.57■■■□□ 2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fancd2Q80V62 1450 aa27.56■■■□□ 2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa27.56■■■□□ 2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa27.55■■■□□ 2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PtprtQ99M80 1454 aa27.52■■■□□ 2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa27.52■■■□□ 2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fam163aQ8CAA5 168 aa27.5■■□□□ 1.99
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mier1Q5UAK0 511 aa27.48■■□□□ 1.99
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Wdr7Q920I9 1489 aa27.45■■□□□ 1.98
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adcy10Q8C0T9 1614 aa27.44■■□□□ 1.98
Cbx1-201ENSMUST00000018810 AI481877A2ALV5 1481 aa27.41■■□□□ 1.98
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abca8bQ8K440 1620 aa27.38■■□□□ 1.97
Cbx1-201ENSMUST00000018810 A2mQ6GQT1 1474 aa27.37■■□□□ 1.97
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Igf1rQ60751 1373 aa27.36■■□□□ 1.97
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