RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001711.5

Hoxc6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc6, Length 1,581 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Carmil1Q6EDY6 1374 aa30.27■■■□□ 2.44
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Adamts12Q811B3 1600 aa30.15■■■□□ 2.42
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa30.14■■■□□ 2.42
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Clip1Q922J3 1391 aa30.14■■■□□ 2.42
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Abca16E9PWJ7 1678 aa30.11■■■□□ 2.41
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 CadpsQ80TJ1 1355 aa29.97■■■□□ 2.39
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 AknaQ80VW7 1404 aa29.96■■■□□ 2.39
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fyco1Q8VDC1 1437 aa29.89■■■□□ 2.37
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Soga1E1U8D0 1418 aa29.88■■■□□ 2.37
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Abca5Q8K448 1642 aa29.87■■■□□ 2.37
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 BC005561E9Q5E2 1589 aa29.83■■■□□ 2.37
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dnajc5P60904 198 aa29.81■■■□□ 2.36
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ankrd26Q811D2 1581 aa29.8■■■□□ 2.36
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Setd5Q5XJV7 1441 aa29.68■■■□□ 2.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 WrnO09053 1401 aa29.68■■■□□ 2.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Eea1Q8BL66 1411 aa29.68■■■□□ 2.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cep170Q6A065 1588 aa29.67■■■□□ 2.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Erich3F6QRE9 1637 aa29.66■■■□□ 2.34
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Aebp1Q640N1 1128 aa29.55■■■□□ 2.32
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Adgrl3Q80TS3 1537 aa29.54■■■□□ 2.32
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 PtprtQ99M80 1454 aa29.52■■■□□ 2.32
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm156Q58A37 223 aa29.5■■■□□ 2.31
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pcf11G3X9Z4 1553 aa29.48■■■□□ 2.31
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 BlmO88700 1416 aa29.46■■■□□ 2.31
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Arap1Q4LDD4 1452 aa29.45■■■□□ 2.31
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa29.45■■■□□ 2.31
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa29.41■■■□□ 2.3
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa29.37■■■□□ 2.29
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa29.36■■■□□ 2.29
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa29.35■■■□□ 2.29
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 AI481877A2ALV5 1481 aa29.35■■■□□ 2.29
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 CntlnA2AM05 1397 aa29.33■■■□□ 2.29
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kdm5bQ80Y84 1544 aa29.33■■■□□ 2.29
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Igf1rQ60751 1373 aa29.25■■■□□ 2.27
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Setbp1Q9Z180 1582 aa29.22■■■□□ 2.27
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mroh2aD3Z750 1679 aa29.21■■■□□ 2.27
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Peg3Q3URU2 1571 aa29.2■■■□□ 2.27
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tiam1Q60610 1591 aa29.19■■■□□ 2.26
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 NhsB1AV60 1647 aa29.18■■■□□ 2.26
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cul7Q8VE73 1689 aa29.18■■■□□ 2.26
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Arhgef11Q68FM7 1552 aa29.18■■■□□ 2.26
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Naip1Q9QWK5 1403 aa29.18■■■□□ 2.26
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa29.17■■■□□ 2.26
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa29.17■■■□□ 2.26
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Znf608Q56A10 1511 aa29.03■■■□□ 2.24
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Atp10dQ8K2X1 1416 aa29.02■■■□□ 2.24
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Prex2Q3LAC4 1598 aa29■■■□□ 2.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa28.98■■■□□ 2.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Arid3cA6PWV5 409 aa28.98■■■□□ 2.23
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa28.98■■■□□ 2.23
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Hoxc6-201ENSMUST00000001711 NexmifQ5DTT1 1515 aa28.93■■■□□ 2.22
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