RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	SCGB1A1	P11684	91 aa		3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE2G1	P62253	170 aa		3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	SYCN	Q0VAF6	134 aa		3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616		Q8N9W7	124 aa		3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	SMR3A	Q99954	134 aa		3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616		V9GYV3	84 aa		3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	JMJD1C	Q15652	2540 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	GNG7	O60262	68 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	APOM	O95445	188 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV1-17	P01599	117 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	PYY3	Q5JQD4	70 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616		Q8N6K4	173 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR82	Q96P67	336 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	OTOR	Q9NRC9	128 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	ATR	Q13535	2644 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616		M0QZK8	103 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	SPINK4	O60575	86 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	HLA-DRB1	P01911	266 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	MT-ND6	P03923	174 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	CBLN1	P23435	193 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	S100A7	P31151	101 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	GNG5	P63218	68 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFA6	Q01524	100 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616		Q56UQ5	140 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616		A8MWL6	223 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	TCRA	P04437	139 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	IL4	P05112	153 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616		Q0VG73	95 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	RASL11A	Q6T310	242 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	BAGE3	Q86Y29	109 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616		S4R3C0	116 aa		3.3	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		3.29	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616		H3BRN7	92 aa		3.29	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	HLA-DQA1	P01909	254 aa		3.29	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	CTSG	P08311	255 aa		3.29	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	CD28	P10747	220 aa		3.29	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	CSN1S1	P47710	185 aa		3.29	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	TPPP2	P59282	170 aa		3.29	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	NDP	Q00604	133 aa		3.29	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	PSG9	Q00887	426 aa		3.29	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	C12orf74	Q32Q52	190 aa		3.29	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		3.29	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		3.29	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		3.29	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	NUP35	Q8NFH5	326 aa		3.29	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		3.29	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	TSKU	Q8WUA8	353 aa		3.29	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		3.29	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		3.28	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		3.28	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2T8	A6NH00	312 aa		3.28	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00587	B1AMM8	73 aa		3.28	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616		H3BUX3	64 aa		3.28	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	NUPR1	O60356	82 aa		3.28	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLC2	P0DOY2	106 aa		3.28	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	GZMB	P10144	247 aa		3.28	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	PKIA	P61925	76 aa		3.28	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	RHOG	P84095	191 aa		3.28	□□□□□ -1.88

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