RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556782.5

PRPF39-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF39, Length 645 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-211ENST00000556782 AP1S3Q96PC3 154 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 CTDSP1Q9GZU7 261 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 KLK12Q9UKR0 248 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.53□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.53□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 RAB19A4D1S5 217 aa3.53□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 C19orf71A6NCJ1 209 aa3.53□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 RBFOX3A6NFN3 312 aa3.53□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 IFNA1P01562 189 aa3.53□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 C1QBP02746 253 aa3.53□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
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PRPF39-211ENST00000556782 BCL2P10415 239 aa3.53□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 GNG4P50150 75 aa3.53□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 RPS20P60866 119 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 SSTP61278 116 aa3.53□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 ELOBQ15370 118 aa3.53□□□□□ -1.84
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PRPF39-211ENST00000556782 SLC51BQ86UW2 128 aa3.53□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa3.53□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 OR2D3Q8NGH3 330 aa3.53□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 BAALCQ8WXS3 180 aa3.53□□□□□ -1.84
PRPF39-211ENST00000556782 UBE2WQ96B02 151 aa3.53□□□□□ -1.84
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PRPF39-211ENST00000556782 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PRPF39-211ENST00000556782 TMEM262E9PQX1 116 aa3.52□□□□□ -1.85
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PRPF39-211ENST00000556782 CACNG7P62955 275 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF39-211ENST00000556782 Q0VG73 95 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF39-211ENST00000556782 MPV17L2Q567V2 206 aa3.52□□□□□ -1.85
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PRPF39-211ENST00000556782 ENHOQ6UWT2 76 aa3.52□□□□□ -1.85
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PRPF39-211ENST00000556782 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF39-211ENST00000556782 C9orf62Q8N4C0 152 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF39-211ENST00000556782 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
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PRPF39-211ENST00000556782 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa3.5□□□□□ -1.85
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PRPF39-211ENST00000556782 NIT2Q9NQR4 276 aa3.49□□□□□ -1.85
PRPF39-211ENST00000556782 REG3AQ06141 175 aa3.48□□□□□ -1.85
PRPF39-211ENST00000556782 FAM231DQ6ZW35 169 aa3.48□□□□□ -1.85
PRPF39-211ENST00000556782 GATD1Q8NB37 220 aa3.48□□□□□ -1.85
PRPF39-211ENST00000556782 C20orf203Q8NBC4 194 aa3.48□□□□□ -1.85
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PRPF39-211ENST00000556782 GTSF1Q8WW33 167 aa3.48□□□□□ -1.85
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