RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554945.1

SRP54-AS1-201, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 600 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.96□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.95□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A1B0GV50 99 aa5.95□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 G3V3Q6 166 aa5.95□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UBE2L6O14933 153 aa5.95□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLPIP03973 132 aa5.95□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RAB5CP51148 216 aa5.95□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CACNG7P62955 275 aa5.95□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.95□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 WDR73Q6P4I2 378 aa5.95□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CFAP161Q6P656 301 aa5.95□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RASL11AQ6T310 242 aa5.95□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KCNRGQ8N5I3 272 aa5.95□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.95□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAM213BQ8TBF2 198 aa5.95□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.95□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.95□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 F2Z2F3 143 aa5.94□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PHOX2AO14813 284 aa5.94□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IGLC6P0CF74 106 aa5.94□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CHTF8P0CG12 524 aa5.94□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RPL35P42766 123 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TPPP3Q9BW30 176 aa5.94□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.94□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NIT2Q9NQR4 276 aa5.94□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 XKRY2A2RUG3 117 aa5.93□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRGC1P0CF51 173 aa5.93□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SULT1A2P50226 295 aa5.93□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 COTL1Q14019 142 aa5.93□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF345Q14585 488 aa5.93□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OR2D3Q8NGH3 330 aa5.93□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.93□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BATF3Q9NR55 127 aa5.93□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TNXBP22105 4242 aa5.93□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.92□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AMTP48728 403 aa5.92□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 COX6A2Q02221 97 aa5.92□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C15orf56Q8N910 161 aa5.92□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C11orf52Q96A22 123 aa5.92□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SMIM12Q96EX1 92 aa5.92□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LINC01600Q96MT4 127 aa5.92□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MANBALQ9NQG1 85 aa5.92□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LRP2P98164 4655 aa5.91□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.91□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NTF3P20783 257 aa5.91□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MAJINQ3KP22 176 aa5.91□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CENPWQ5EE01 88 aa5.91□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GTSF1Q8WW33 167 aa5.91□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5.9□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa5.9□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HMSDA8MTL9 139 aa5.9□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IFNA1P01562 189 aa5.9□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GNG4P50150 75 aa5.9□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CCL20P78556 96 aa5.9□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.9□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 STPG4Q8N801 248 aa5.9□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.9□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BIN3Q9NQY0 253 aa5.9□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GNG13Q9P2W3 67 aa5.9□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.89□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SMLR1H3BR10 107 aa5.89□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 H7C423 109 aa5.89□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BCL2L11O43521 198 aa5.89□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.89□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa5.89□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C9orf62Q8N4C0 152 aa5.89□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.89□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.89□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RNF213Q63HN8 5207 aa5.88□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.88□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A0J9YXV3 536 aa5.88□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RAB19A4D1S5 217 aa5.88□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TEX46H3BTG2 121 aa5.88□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PDE6DO43924 150 aa5.88□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NCR2O95944 276 aa5.88□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.88□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LYPD6BQ8NI32 183 aa5.88□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A096LNI7 61 aa5.87□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CTRLP40313 264 aa5.87□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP10-8P60410 259 aa5.87□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TWIST1Q15672 202 aa5.87□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RGS21Q2M5E4 152 aa5.87□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 REG3GQ6UW15 175 aa5.87□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GATD1Q8NB37 220 aa5.87□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NUDT10Q8NFP7 164 aa5.87□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NUDT11Q96G61 164 aa5.87□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CNFNQ9BYD5 112 aa5.87□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 APCSP02743 223 aa5.86□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FGF6P10767 208 aa5.86□□□□□ -1.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
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