RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549400.1

PTPRB-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRB, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-207ENST00000549400 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa2.9□□□□□ -1.95
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PTPRB-207ENST00000549400 ARL14EPLP0DKL9 152 aa2.9□□□□□ -1.95
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PTPRB-207ENST00000549400 FHL2Q14192 279 aa2.9□□□□□ -1.95
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PTPRB-207ENST00000549400 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 DCANP1Q8TF63 244 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 CCL17Q92583 94 aa2.89□□□□□ -1.95
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PTPRB-207ENST00000549400 C6orf223Q8N319 242 aa2.88□□□□□ -1.95
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PTPRB-207ENST00000549400 K7EIM0 57 aa2.87□□□□□ -1.95
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PTPRB-207ENST00000549400 LINC01560Q8TB33 94 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 TOMM6Q96B49 74 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 CYSTM1Q9H1C7 97 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 DPM3Q9P2X0 92 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 XCL2Q9UBD3 114 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 COL6A6A6NMZ7 2263 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRB-207ENST00000549400 ZFHX3Q15911 3703 aa2.86□□□□□ -1.95
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