RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547715.1

PTPRB-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-205ENST00000547715 IGHV3-33P01772 117 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-205ENST00000547715 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-205ENST00000547715 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-205ENST00000547715 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-205ENST00000547715 TDRG1Q3Y452 100 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-205ENST00000547715 MUC21Q5SSG8 566 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-205ENST00000547715 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-205ENST00000547715 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-205ENST00000547715 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-205ENST00000547715 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-205ENST00000547715 AP1S3Q96PC3 154 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-205ENST00000547715 A0A1B0GV72 72 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 J3QR89 54 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 APCSP02743 223 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 MIC13Q5XKP0 118 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 OR1L4Q8NGR5 311 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 OCC1Q8TAD7 63 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 RASL10AQ92737 203 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 TM2D2Q9BX73 214 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 RPH3ALQ9UNE2 315 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 A6NDN8 102 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 TIRAPP58753 221 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 V9GYV3 84 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 OR7C2O60412 319 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 GNG4P50150 75 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 PDE6HQ13956 83 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 TSKUQ8WUA8 353 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 SPXQ9BT56 116 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF492Q9P255 531 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 TAX1BP3O14907 124 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 RS1O15537 224 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 PYYP10082 97 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 TAS2R45P59539 299 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 LAGE3Q14657 143 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 Q8TAT8 98 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 GAGE10A6NGK3 116 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 GCHFRP30047 84 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF138P52744 262 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 H3BRM9 83 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 FAM159AQ6UWV7 190 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-205ENST00000547715 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 A0A1W2PRE2 83 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 LELP1Q5T871 98 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 C18orf32Q8TCD1 76 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 BAALCQ8WXS3 180 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 IGLV2-8P01709 118 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 CT83Q5H943 113 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 FA2HQ7L5A8 372 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 Q8N3U1 123 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 FAM231BA6NCW3 169 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 M0R2P5 195 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 C9orf118A6NHY6 69 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 Q6AWC8 147 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 PRADC1Q9BSG0 188 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 LRP2P98164 4655 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 K7EP34 96 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 GNRH2O43555 120 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 NTF3P20783 257 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 MPV17L2Q567V2 206 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 CENPWQ5EE01 88 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 A0A1B0GW15 77 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 K7EN84 100 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-205ENST00000547715 COX8AP10176 69 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms