RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 ETDBQ3ZM63 59 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 LRRK2Q5S007 2527 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 MBD6Q96DN6 1003 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 MIAQ16674 131 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 P0C879 139 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 REG3AQ06141 175 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 A0A0J9YXV3 536 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 H3BT86 120 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 NCR3O14931 201 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 PLA2G2AP14555 144 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 ODF1Q14990 250 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 FAM222AQ5U5X8 452 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 LY6G6DO95868 133 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 ASPHD1Q5U4P2 390 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 PROP1O75360 226 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 MUC7Q8TAX7 377 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 C19orf84I3L1E1 186 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 C11orf1Q9H5F2 150 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 MSMPQ1L6U9 139 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 ESM1Q9NQ30 184 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 TEN1Q86WV5 123 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 NDUFA7O95182 113 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 Q6ZUT4 128 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 BDP1A6H8Y1 2624 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 DEFB4AO15263 64 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 P0DMU3 169 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 FAM231AP0DMU4 169 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 FAM231CP0DMU5 169 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 Q6ZSV7 163 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 COX17Q14061 63 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 WFDC11Q8NEX6 87 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 A0A0J9YXY3 114 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 MAJINQ3KP22 176 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 ZFAND3Q9H8U3 227 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 TTC28Q96AY4 2481 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 A0A1B0GXF2 115 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 H0Y9J4 135 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 CFAP126Q5VTH2 177 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF702PQ9H963 129 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 COL4A2P08572 1712 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 LELP1Q5T871 98 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 Q6ZTI0 123 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 RS1O15537 224 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 LECT2O14960 151 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 NUPR2A6NF83 97 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 TIMM17BO60830 172 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 IGLC6P0CF74 106 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 TDRG1Q3Y452 100 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 MLST8Q9BVC4 326 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 WFDC9Q8NEX5 89 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 C20orf173Q96LM9 149 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-226ENST00000546160 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 U3KQK5 164 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 Q8N6K4 173 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 UPK3BQ9BT76 320 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 UBE2D1P51668 147 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 DAND5Q8N907 189 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 A0A087WZ39 114 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM223A0PJW6 202 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 M0QY20 66 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 NDUFC2O95298 119 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 BPY2O14599 106 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 IGLV1-40P01703 118 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 LINC01006Q8NI28 216 aa4.76□□□□□ -1.65
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