RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 MUC4Q99102 2169 aa6.33□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 SCGB1A1P11684 91 aa6.33□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 KIR2DL4Q99706 377 aa6.33□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.33□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.33□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 ANK2Q01484 3957 aa6.32□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.32□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.32□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 MRAP2Q96G30 205 aa6.32□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 RNF185Q96GF1 192 aa6.32□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 C9orf85Q96MD7 179 aa6.32□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.32□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 LINC01549A6NIU2 74 aa6.32□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.32□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.32□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.32□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.31□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.31□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 F8W1H4 67 aa6.31□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 DPM2O94777 84 aa6.31□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 NXPH4O95158 308 aa6.31□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 XGP55808 180 aa6.31□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.31□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 U3KQK5 164 aa6.31□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 TNFRSF6BO95407 300 aa6.3□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 ZNF415Q09FC8 603 aa6.3□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 JPT2Q9H910 190 aa6.3□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 NACAE9PAV3 2078 aa6.29□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 E9PLD3 99 aa6.29□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 NFE4Q86UQ8 179 aa6.29□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.29□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.29□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 NOTCH1P46531 2555 aa6.29□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.29□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 FOXI1Q12951 378 aa6.29□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 RRN3P1Q2M238 152 aa6.29□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 ZNF876PQ49A33 203 aa6.29□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.29□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.29□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 OR11H2Q8NH07 326 aa6.29□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.28□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.28□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 SIVA1O15304 175 aa6.28□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.28□□□□□ -1.4
THBS3-210ENST00000541576 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.27□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 M0R2P5 195 aa6.27□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 MGPP08493 103 aa6.27□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 LINC00315P59091 139 aa6.27□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.27□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 MDFIQ99750 246 aa6.27□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 SPATA25Q9BR10 227 aa6.27□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 SPXQ9BT56 116 aa6.27□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 ZNF815PA8K554 130 aa6.27□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 KRTAP10-11P60412 298 aa6.27□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 Q6ZUT4 128 aa6.27□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.27□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 A0A087WWL8 130 aa6.27□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.27□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 APOC4P55056 127 aa6.26□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 HERV-K104P63124 156 aa6.26□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.26□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 CDIP1Q9H305 208 aa6.26□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.26□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.26□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 NRACQ8N912 160 aa6.26□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.26□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 Q1RN00 199 aa6.25□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 C16orf74Q96GX8 76 aa6.25□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 CRYGDP07320 174 aa6.25□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.25□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 IL17DQ8TAD2 202 aa6.25□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 A8MWV9 139 aa6.25□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 F5H697 171 aa6.25□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.25□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 RASL10AQ92737 203 aa6.24□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 TM2D2Q9BX73 214 aa6.24□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.24□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.24□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 ZNF56Q15929 161 aa6.24□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.24□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.24□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.24□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 C9JAW5 83 aa6.23□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 DEFB135Q30KP9 77 aa6.23□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 PRO0461Q9UI25 63 aa6.23□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.23□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 CCDC179H3BU77 68 aa6.23□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 LAGE3Q14657 143 aa6.23□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
THBS3-210ENST00000541576 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms