RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL6A5A8TX70 2615 aa4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A8MTW9 85 aa4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 F2Z2F3 143 aa4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGLC3P0DOY3 106 aa4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ASIPP42127 132 aa4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CRIP1P50238 77 aa4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RIGQ13278 110 aa4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PMAIP1Q13794 54 aa4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C9orf85Q96MD7 179 aa4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 JPT2Q9H910 190 aa4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STAB1Q9NY15 2570 aa4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.11□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GRIFINA4D1Z8 144 aa4.1□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HIGD1CA8MV81 97 aa4.1□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CXCL1P09341 107 aa4.1□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HTN1P15515 57 aa4.1□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CACNG7P62955 275 aa4.1□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ELOBQ15370 118 aa4.1□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MUC21Q5SSG8 566 aa4.1□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PGLYRP4Q96LB8 373 aa4.1□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PYGO2Q9BRQ0 406 aa4.1□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EDA2RQ9HAV5 297 aa4.1□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 XCL2Q9UBD3 114 aa4.1□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.09□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.09□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1B0GUT8 65 aa4.09□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A6NDN8 102 aa4.09□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPINK4O60575 86 aa4.09□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRGC2P03986 189 aa4.09□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPANXN1Q5VSR9 72 aa4.09□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AMTNQ6UX39 209 aa4.09□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q6ZN92 141 aa4.09□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q6ZUT4 128 aa4.09□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa4.09□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NUP35Q8NFH5 326 aa4.09□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CARD19Q96LW7 228 aa4.09□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa4.09□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa4.09□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HBBP68871 147 aa4.09□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa4.09□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TWIST1Q15672 202 aa4.09□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRR9Q5T870 116 aa4.09□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.09□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.09□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WFDC10AQ9H1F0 79 aa4.09□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.09□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.08□□□□□ -1.76
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SNURFLB1AK76 121 aa4.08□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 H3BVH4 76 aa4.08□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GNRH2O43555 120 aa4.08□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NDUFC2O95298 119 aa4.08□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MT-ND6P03923 174 aa4.08□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARMS2P0C7Q2 107 aa4.08□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IFITM1P13164 125 aa4.08□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.08□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.08□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.08□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DNAH3Q8TD57 4116 aa4.08□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VWFP04275 2813 aa4.08□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HLA-DQA1P01909 254 aa4.07□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MT-ATP8P03928 68 aa4.07□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR5AL1P0C617 328 aa4.07□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.07□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q0VG73 95 aa4.07□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RRN3P1Q2M238 152 aa4.07□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa4.07□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF493Q6ZR52 646 aa4.07□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GTSF1Q8WW33 167 aa4.07□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C16orf74Q96GX8 76 aa4.07□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM70Q9BUB7 260 aa4.07□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GNB1LQ9BYB4 327 aa4.07□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 M0R381 172 aa4.07□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP10-11P60412 298 aa4.07□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DEFB121Q5J5C9 76 aa4.07□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C2orf48Q96LS8 159 aa4.07□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.07□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MUC4Q99102 2169 aa4.06□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.06□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 J3QQQ9 107 aa4.06□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 M0R2P5 195 aa4.06□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 APCSP02743 223 aa4.06□□□□□ -1.76
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