RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528145.5

ATG13-210, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 3

Gene ATG13, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-210ENST00000528145 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 ATRAIDQ6UW56 229 aa9.02□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.02□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.01□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 I3L3M4 83 aa9.01□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 NPYP01303 97 aa9.01□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 PPBPP02775 128 aa9.01□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 AMTP48728 403 aa9.01□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 MPV17L2Q567V2 206 aa9.01□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 ORMDL3Q8N138 153 aa9.01□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 TMEM243Q9BU79 118 aa9.01□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.01□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.01□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 A0A087WX48 190 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 TNFRSF6BO95407 300 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 TSHBP01222 138 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 APCSP02743 223 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 BTF3P20290 206 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 PMCHP20382 165 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 GAGE6Q13070 117 aa9□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 TMEM262E9PQX1 116 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 PHOX2AO14813 284 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 PKIAP61925 76 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 LAGE3Q14657 143 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 PRELID3AQ96N28 172 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 C20orf78Q9BR46 151 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 HLA-DQA1P01909 254 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 ELOBQ15370 118 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 Q8N976 141 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 Q9HAA7 133 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 KLK12Q9UKR0 248 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 VCYO14598 125 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 RBX1P62877 108 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
ATG13-210ENST00000528145 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 UBE2L6O14933 153 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 ESDP10768 282 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 TNP2Q05952 138 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 COX19Q49B96 90 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 NFE4Q86UQ8 179 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 YPEL4Q96NS1 127 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 KIR2DL4Q99706 377 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 MT-ND6P03923 174 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 FCER1GP30273 86 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 PKD1P98161 4303 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 A0A1B0GUV1 79 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 UBE2WQ96B02 151 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 H7C423 109 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 FGF6P10767 208 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 ENHOQ6UWT2 76 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 A0A1B0GVY2 172 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 PRSS47A8MTI9 375 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 TCAPO15273 167 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 CRPP02741 224 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 PRR34Q9NV39 138 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 PKHD1P08F94 4074 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.91□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.9□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 REG3AQ06141 175 aa8.9□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 Q0VG73 95 aa8.9□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 Q8N8P6 123 aa8.9□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.9□□□□□ -0.98
ATG13-210ENST00000528145 PSCAO43653 123 aa8.89□□□□□ -0.99
ATG13-210ENST00000528145 MIAQ16674 131 aa8.89□□□□□ -0.99
ATG13-210ENST00000528145 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.89□□□□□ -0.99
ATG13-210ENST00000528145 RMI2Q96E14 147 aa8.89□□□□□ -0.99
ATG13-210ENST00000528145 TM2D2Q9BX73 214 aa8.89□□□□□ -0.99
ATG13-210ENST00000528145 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.4 ms