RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511105.1

PTPN13-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, human

TSL 3

Gene PTPN13, Length 645 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN13-208	ENST00000511105	ORM1	P02763	201 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	CRIP1	P50238	77 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	CCL20	P78556	96 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	HAMP	P81172	84 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	FAM210B	Q96KR6	192 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	ODF3	Q96PU9	254 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	RBAKDN	A6NC62	111 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	C16orf90	A8MZG2	172 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	SNAI2	O43623	268 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	OR5AL1	P0C617	328 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	CTRL	P40313	264 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	LINC00315	P59091	139 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	SMUG1	Q53HV7	270 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105		Q6AWC8	147 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	ASB13	Q8WXK3	278 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	PRO0255	Q9UI72	69 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105		M0R2P5	195 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	TAAR5	O14804	337 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	SRI	P30626	198 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	SERF2	P84101	59 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	COTL1	Q14019	142 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105		B4DEV8	164 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105		H3BVH4	76 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	LECT2	O14960	151 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	SH2D1A	O60880	128 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	PFDN1	O60925	122 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	NMB	P08949	121 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	GZMB	P10144	247 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	UBE2G1	P62253	170 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	FAM104A	Q969W3	186 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	MUC4	Q99102	2169 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105		A0A1W2PRE2	83 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105		M0R381	172 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	AKR1C3	P42330	323 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	HERVK_113	P61574	105 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	C5orf47	Q569G3	176 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	STOML3	Q8TAV4	291 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	KCNS1	Q96KK3	526 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	DERL1	Q9BUN8	251 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105		A0A0J9YXV3	536 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105		A0A1B0GVG6	124 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PTPN13-208	ENST00000511105		H0Y9J4	135 aa		3.06	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms