RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497977.1

PTPRN-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-218ENST00000497977 COTL1Q14019 142 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 NIT1Q86X76 327 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 GATD1Q8NB37 220 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 RNF185Q96GF1 192 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 D6R8Y8 96 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 RAB4AP20338 218 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 MRAP2Q96G30 205 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 Q9HAA7 133 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 A0A087WTM6 91 aa7□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 ANGP03950 147 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 PMCHP20382 165 aa7□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 CKS2P33552 79 aa7□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 IQCJQ1A5X6 159 aa7□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 Q8N976 141 aa7□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 KLK12Q9UKR0 248 aa7□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 H7C423 109 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 TCAPO15273 167 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 HLA-DQA1P01909 254 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 MIAQ16674 131 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 C14orf177Q52M58 125 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 UBE2WQ96B02 151 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 TMEM243Q9BU79 118 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 ST20Q9HBF5 79 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 A0A1B0GUV1 79 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 I3L3M4 83 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 NPYP01303 97 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 APCSP02743 223 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 AMTP48728 403 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 VCYO14598 125 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 S100A1P23297 94 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 ORMDL3Q8N138 153 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 NRACQ8N912 160 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 TMEM101Q96IK0 257 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 PRELID3AQ96N28 172 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 YPEL4Q96NS1 127 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRN-218ENST00000497977 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 CDK2AP2O75956 126 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 TNFRSF6BO95407 300 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 MT-ND6P03923 174 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 RBX1P62877 108 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 GAGE6Q13070 117 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 TMEM18Q96B42 140 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 KIR2DL4Q99706 377 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 PPBPP02775 128 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 GCSHP23434 173 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 COX19Q49B96 90 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 FCER1GP30273 86 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 Q8N3U1 123 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 Q8N814 137 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 C20orf78Q9BR46 151 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 HERC2O95714 4834 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 REG3AQ06141 175 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 MPV17L2Q567V2 206 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 CFAP161Q6P656 301 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 PRR34Q9NV39 138 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 TSHBP01222 138 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 RAB5AP20339 215 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 ENHOQ6UWT2 76 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 BAALCQ8WXS3 180 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 DNAH2Q9P225 4427 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRN-218ENST00000497977 PHOX2AO14813 284 aa6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms