RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 Q6ZRU5 148 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 C9JQL5 133 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 P01737 135 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 RPS20P60866 119 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 hDV102S1A0JD36 115 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 SNAI2O43623 268 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 CHTF8P0CG12 524 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM97Q5BJF2 176 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 CLRN3Q8NCR9 226 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 REG3AQ06141 175 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 LINC01551Q86U37 167 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 A0A087WYN8 130 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 SLPIP03973 132 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 CXCL1P09341 107 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 SMIM17P0DL12 118 aa11.73□□□□□ -0.53
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PTPRN-217ENST00000489650 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 NDUFA5Q16718 116 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 FAM231DQ6ZW35 169 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM218A2RU14 115 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 F8W036 122 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 OR5AL1P0C617 328 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 ADIRFQ15847 76 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 C20orf203Q8NBC4 194 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 OR2D3Q8NGH3 330 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 C19orf71A6NCJ1 209 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 GATCO43716 136 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 IQCJQ1A5X6 159 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 NUDT10Q8NFP7 164 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 NUDT11Q96G61 164 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 GFRA4Q9GZZ7 299 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRN-217ENST00000489650 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 K7EN84 100 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 MGPP08493 103 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 RPL23P62829 140 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 SEC11CQ9BY50 192 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 OSTCQ9NRP0 149 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 AP5S1Q9NUS5 200 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 ISOC2Q96AB3 205 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 AP1S3Q96PC3 154 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 A8MWL6 223 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 M0QY20 66 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 PHOX2AO14813 284 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 GZMBP10144 247 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 ODF1Q14990 250 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 CT83Q5H943 113 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 SPACA4Q8TDM5 124 aa11.68□□□□□ -0.54
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PTPRN-217ENST00000489650 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 PPP1R2P9O14990 202 aa11.67□□□□□ -0.54
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PTPRN-217ENST00000489650 RNF185Q96GF1 192 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 TPPP3Q9BW30 176 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 DPH3P1Q9H4G8 78 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 F2Z2F3 143 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 MT-ND4LP03901 98 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM243Q9BU79 118 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRN-217ENST00000489650 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa11.65□□□□□ -0.54
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PTPRN-217ENST00000489650 FAM231BA6NCW3 169 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 CACNG7P62955 275 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 COX6A2Q02221 97 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 BORCS7Q96B45 105 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 ANAPC16Q96DE5 110 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 PLAC8Q9NZF1 115 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 H7C1H1 209 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 C7orf33Q8WU49 177 aa11.63□□□□□ -0.55
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PTPRN-217ENST00000489650 GTSF1Q8WW33 167 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 GAGE12HA6NDE8 117 aa11.62□□□□□ -0.55
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PTPRN-217ENST00000489650 C15orf56Q8N910 161 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 IGLC6P0CF74 106 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 MAJINQ3KP22 176 aa11.61□□□□□ -0.55
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PTPRN-217ENST00000489650 WDR73Q6P4I2 378 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 RASL11AQ6T310 242 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 V9GYV3 84 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 ADCYAP1P18509 176 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 LINC01600Q96MT4 127 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 CTDSP1Q9GZU7 261 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 RPS10P46783 165 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 LYZL1Q6UWQ5 148 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRN-217ENST00000489650 SMIM15Q7Z3B0 74 aa11.59□□□□□ -0.55
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