RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 EVI2AP22794 236 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 CTRLP40313 264 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 RAB4BP61018 213 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 ELOBQ15370 118 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 LINC01620Q4KN68 170 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 DNLZQ5SXM8 178 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 FAM74A4Q5TZK3 123 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF493Q6ZR52 646 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 POM121L12Q8N7R1 296 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 C11orf45Q8TAV5 145 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 NAT8BQ9UHF3 227 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 TRGV2A0A075B6R0 118 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRC-211ENST00000484135 F2Z2F3 143 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 CRYGDP07320 174 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRC-211ENST00000484135 CFAP126Q5VTH2 177 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRC-211ENST00000484135 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRC-211ENST00000484135 PRR34Q9NV39 138 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRC-211ENST00000484135 Q9UF83 564 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRC-211ENST00000484135 FAM231BA6NCW3 169 aa3.27□□□□□ -1.89
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PTPRC-211ENST00000484135 A8MWV9 139 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRC-211ENST00000484135 TMEM191AQ9H0A3 160 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRC-211ENST00000484135 ZFAND6Q6FIF0 208 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRC-211ENST00000484135 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 SLC25A29Q8N8R3 303 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 GATD1Q8NB37 220 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 PTH2Q96A98 100 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 DPH3P1Q9H4G8 78 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-211ENST00000484135 HHLA3Q9XRX5 114 aa3.25□□□□□ -1.89
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