RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468164.1

C9orf3-212, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 849 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-212ENST00000468164 J3QL48 77 aa8.75□□□□□ -1.01
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C9orf3-212ENST00000468164 RASL11AQ6T310 242 aa8.75□□□□□ -1.01
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C9orf3-212ENST00000468164 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.75□□□□□ -1.01
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C9orf3-212ENST00000468164 HIGD1CA8MV81 97 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 CLLU1Q5K131 121 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.67□□□□□ -1.02
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C9orf3-212ENST00000468164 V9GYV3 84 aa8.66□□□□□ -1.02
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C9orf3-212ENST00000468164 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.65□□□□□ -1.02
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C9orf3-212ENST00000468164 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.64□□□□□ -1.03
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C9orf3-212ENST00000468164 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 IFITM2Q01629 132 aa8.63□□□□□ -1.03
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C9orf3-212ENST00000468164 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.61□□□□□ -1.03
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C9orf3-212ENST00000468164 CHTF8P0CG12 524 aa8.61□□□□□ -1.03
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C9orf3-212ENST00000468164 I3L3M4 83 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 GAS8-AS1O95177 125 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 MT-ND4LP03901 98 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 SLPIP03973 132 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 C15orf56Q8N910 161 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 BTF3L4Q96K17 158 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 ST20Q9HBF5 79 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 S100A8P05109 93 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 CFAP161Q6P656 301 aa8.59□□□□□ -1.03
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