RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468164.1

C9orf3-212, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 849 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-212ENST00000468164 J3QL48 77 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 TWIST1Q15672 202 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 RASL11AQ6T310 242 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 IQCJQ1A5X6 159 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 LINC01551Q86U37 167 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM243Q9BU79 118 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 UBE2L6O14933 153 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 PRSS1P07477 247 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 REG3AQ06141 175 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 WDR73Q6P4I2 378 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 BORCS7Q96B45 105 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 NIT2Q9NQR4 276 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 CTRLP40313 264 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 ADIRFQ15847 76 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 CT83Q5H943 113 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 PRR34Q9NV39 138 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 NAT8Q9UHE5 227 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 AMTP48728 403 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 COTL1Q14019 142 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 OSTCQ9NRP0 149 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 C9JQL5 133 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 GTSF1Q8WW33 167 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 hDV102S1A0JD36 115 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 GATD1Q8NB37 220 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 TSKUQ8WUA8 353 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 ISOC2Q96AB3 205 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 CNFNQ9BYD5 112 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 A0A1B0GUV1 79 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 FAM231BA6NCW3 169 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 HIGD1CA8MV81 97 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 CLLU1Q5K131 121 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 A0A1B0GUT8 65 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 V9GYV3 84 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 APCSP02743 223 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 RIGQ13278 110 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 DPH3Q96FX2 82 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-212ENST00000468164 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 PANO1I0J062 215 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 IFITM2Q01629 132 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 NUP35Q8NFH5 326 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 PPP1R2P9O14990 202 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 PMCHP20382 165 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 NCR2O95944 276 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 CHTF8P0CG12 524 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 FGF6P10767 208 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 UQCC3Q6UW78 93 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 A0A1B0GW15 77 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 I3L3M4 83 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 GAS8-AS1O95177 125 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 MT-ND4LP03901 98 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 SLPIP03973 132 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 C15orf56Q8N910 161 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 BTF3L4Q96K17 158 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 ST20Q9HBF5 79 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 S100A8P05109 93 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf3-212ENST00000468164 CFAP161Q6P656 301 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.6 ms