RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466020.1

CLHC1-211, Transcript of clathrin heavy chain linker domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene CLHC1, Length 153 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1-211ENST00000466020 PI4KAP42356 2102 aa-1.16□□□□□ -2.59
CLHC1-211ENST00000466020 ZNF236Q9UL36 1845 aa-1.16□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 E7EQ34 232 aa-1.16□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 J3QLW9 94 aa-1.16□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 SERPINB1P30740 379 aa-1.16□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 PSPHP78330 225 aa-1.16□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 LINC01545Q5VT33 79 aa-1.16□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 DEFB105AQ8NG35 78 aa-1.16□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP-1.16□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 CCDC32Q9BV29 185 aa-1.16□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 DOCK1Q14185 1865 aa-1.16□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 DMXL1Q9Y485 3027 aa-1.16□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 LAMA3Q16787 3333 aa-1.17□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 ERCC6Q03468 1493 aa-1.17□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 SACSQ9NZJ4 4579 aa-1.17□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 LRRC37A2A6NM11 1700 aa-1.17□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP-1.17□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-1.17□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 LRRC37A3O60309 1634 aa-1.17□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 FAM107AO95990 144 aa-1.17□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 CCL18P55774 89 aa-1.17□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 DEFB112Q30KQ8 113 aa-1.17□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 CLLU1Q5K131 121 aa-1.17□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa-1.17□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 DEFB123Q8N688 67 aa-1.17□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 CCDC115Q96NT0 180 aa-1.17□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 LINC00472Q9H8W2 130 aa-1.17□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-1.17□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 TEX15Q9BXT5 2789 aa-1.17□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 PRDM2Q13029 1718 aa-1.18□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 NBASA2RRP1 2371 aa-1.18□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-1.18□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 PITX3O75364 302 aa-1.18□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 MT-ND4LP03901 98 aa-1.18□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 HLA-DRB4P13762 266 aa-1.18□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 TMED4Q7Z7H5 227 aa-1.18□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 BANF2Q9H503 90 aa-1.18□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-1.18□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa-1.18□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa-1.19□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 H0YJX3 145 aa-1.19□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 TNFP01375 233 aa-1.19□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 RBP4P02753 201 aa-1.19□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 SMIM6P0DI80 62 aa-1.19□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP-1.19□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-1.19□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 MRC1P22897 1456 aa-1.19□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 GAPVD1Q14C86 1478 aa-1.19□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-1.19□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP-1.19□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 TRANK1O15050 2925 aa-1.2□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 NSD3Q9BZ95 1437 aa-1.2□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 M0R135 149 aa-1.2□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 Q6JHZ5 121 aa-1.2□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 BOLA2Q9H3K6 86 aa-1.2□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 RPRMQ9NS64 109 aa-1.2□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 LINC00312Q9Y6C7 94 aa-1.2□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-1.2□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 PAEPP09466 180 aa-1.21□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 PIRTP0C851 137 aa-1.21□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 UBE2G1P62253 170 aa-1.21□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 TMEM244Q5VVB8 128 aa-1.21□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 MNS1Q8NEH6 495 aa-1.21□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 SMIM4Q8WVI0 70 aa-1.21□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 CALML5Q9NZT1 146 aa-1.21□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 STOML2Q9UJZ1 356 aa-1.21□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 SYNJ1O43426 1573 aa-1.21□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 KIAA0556O60303 1618 aa-1.22□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 PXDNQ92626 1479 aa-1.22□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa-1.22□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 M0R129 80 aa-1.22□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 YPEL1O60688 119 aa-1.22□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 SMIM24O75264 130 aa-1.22□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 DPM2O94777 84 aa-1.22□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 MT1AP04731 61 aa-1.22□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-1.22□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 MIC13Q5XKP0 118 aa-1.22□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa-1.22□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-1.22□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 VSTM2AQ8TAG5 236 aa-1.22□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 MAFIPQ8WZ33 124 aa-1.22□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 GID8Q9NWU2 228 aa-1.22□□□□□ -2.6
CLHC1-211ENST00000466020 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-1.23□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 TMEM238C9JI98 176 aa-1.23□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 PFDN1O60925 122 aa-1.23□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 PPP1R17O96001 155 aa-1.23□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 IFNA17P01571 189 aa-1.23□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 OR8I2Q8N0Y5 310 aa-1.23□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa-1.23□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 AMELXQ99217 191 aa-1.23□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 R4GMQ9 66 aa-1.23□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 DNAH8Q96JB1 4490 aa-1.23□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-1.23□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 HMGXB3Q12766 1538 aa-1.24□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-1.24□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 ADGRB1O14514 1584 aa-1.24□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 TMEM170BQ5T4T1 132 aa-1.24□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 APLNQ9ULZ1 77 aa-1.24□□□□□ -2.61
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