RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 OVOL2Q9BRP0 275 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-210ENST00000462363 HIGD1BQ9P298 99 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-210ENST00000462363 XCL2Q9UBD3 114 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-210ENST00000462363 CYSLTR1Q9Y271 337 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-210ENST00000462363 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa4.05□□□□□ -1.76
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PTPRC-210ENST00000462363 H7C1H1 209 aa4.04□□□□□ -1.76
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PTPRC-210ENST00000462363 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4□□□□□ -1.77
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PTPRC-210ENST00000462363 PF4P02776 101 aa4□□□□□ -1.77
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PTPRC-210ENST00000462363 SPANXA1Q9NS26 97 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-210ENST00000462363 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4□□□□□ -1.77
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PTPRC-210ENST00000462363 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1B0GWB2 263 aa3.99□□□□□ -1.77
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