RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 GAGE1Q13065 139 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 GAGE4Q13068 117 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 GAGE5Q13069 117 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 GAGE13Q4V321 117 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 Q9H8V8 135 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 LINC00694P0DN24 101 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 PRSS47A8MTI9 375 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 HIST1H2BKO60814 126 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 HIST1H2BJP06899 126 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 HIST1H2BOP23527 126 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 HIST1H2BBP33778 126 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 HIST1H2BDP58876 126 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 RAB5BP61020 215 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 UBE2D3P61077 147 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 HIST1H2BCP62807 126 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 UBE2D2P62837 147 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 IQCJQ1A5X6 159 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 VCYO14598 125 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 PMCHP20382 165 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP10-2P60368 255 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 TTC32Q5I0X7 151 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PRAME-208ENST00000438888 A0A096LPF7 62 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 I3L3M4 83 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 Q0VG73 95 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 ESRGQ1W209 222 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 BAGE3Q86Y29 109 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 Q8N8P6 123 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 FA2HQ7L5A8 372 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 Q8N1X5 172 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 KIR2DL4Q99706 377 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 COTL1Q14019 142 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 TCAPO15273 167 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 TSHBP01222 138 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 FCER1GP30273 86 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 NIT1Q86X76 327 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 UPK3BQ9BT76 320 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 K7EMI3 77 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 SERF1AO75920 110 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 LINC00614P0C842 121 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 NDUFA6P56556 154 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 LINC01546A6NGU7 62 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 LAGE3Q14657 143 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PRAME-208ENST00000438888 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 AMTP48728 403 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 TIRAPP58753 221 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 LINC00310P59036 64 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 HSBP1O75506 76 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 S100A6P06703 90 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 SIVA1O15304 175 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 NUPR1O60356 82 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 LELP1Q5T871 98 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 TMEM243Q9BU79 118 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 ESDP10768 282 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 G0S2P27469 103 aa8.43□□□□□ -1.06
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