RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417027.1

RPS3AP9-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP9, Length 792 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP9-201ENST00000417027 CSPG4Q6UVK1 2322 aa1.71□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa1.7□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa1.7□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 J3QR89 54 aa1.7□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 M0R129 80 aa1.7□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 HCRTO43612 131 aa1.7□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 CD3DP04234 171 aa1.7□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 CKS2P33552 79 aa1.7□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 KRTAP12-3P60328 96 aa1.7□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 CASC2Q6XLA1 102 aa1.7□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF720Q7Z2F6 126 aa1.7□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 TEN1Q86WV5 123 aa1.7□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP1.7□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa1.7□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 BIRC6Q9NR09 4857 aa1.7□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP1.69□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP1.69□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa1.69□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa1.69□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 KDELR1P24390 212 aa1.69□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 CD52P31358 61 aa1.69□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 RPS25P62851 125 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 SPRNQ5BIV9 151 aa1.69□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 CLLU1Q5K131 121 aa1.69□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 C10orf111Q8N326 155 aa1.69□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 MMGT1Q8N4V1 131 aa1.69□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa1.69□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 TANC1Q9C0D5 1861 aa1.69□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 RYR1P21817 5038 aa1.68□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 MED13Q9UHV7 2174 aa1.68□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 RYR3Q15413 4870 aa1.68□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa1.68□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 H3BRM9 83 aa1.68□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 EDF1O60869 148 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 DNAL4O96015 105 aa1.68□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 ETV6P41212 452 aa1.68□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 NCS1P62166 190 aa1.68□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 NEDD8Q15843 81 aa1.68□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 CTAGE3PQ8IX95 158 aa1.68□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 C5orf17Q8NAS9 161 aa1.68□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 ERG28Q9UKR5 140 aa1.68□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 SNURFQ9Y675 71 aa1.68□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 NUP210LQ5VU65 1888 aa1.68□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 EML6Q6ZMW3 1958 aa1.68□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 APC2O95996 2303 aa1.68□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 ACANP16112 2415 aa1.68□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 MICAL3Q7RTP6 2002 aa1.67□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 HYDINQ4G0P3 5121 aa1.67□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 MGAQ8IWI9 3026 aa1.67□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCL25O15444 150 aa1.67□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP1.67□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 TSPAN19P0C672 248 aa1.67□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 IL9P15248 144 aa1.67□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 COX7CP15954 63 aa1.67□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP1.67□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR10AG1Q8NH19 301 aa1.67□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP1.67□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 MED9Q9NWA0 146 aa1.67□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 Q9Y3F1 56 aa1.67□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 MPC1Q9Y5U8 109 aa1.67□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 CITO14578 2027 aa1.67□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 MGAM2Q2M2H8 2515 aa1.67□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP1.67□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 APCP25054 2843 aa1.67□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 FREM1Q5H8C1 2179 aa1.66□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 PTPRDP23468 1912 aa1.66□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 TENM1Q9UKZ4 2725 aa1.66□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 CDC42EP2O14613 210 aa1.66□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 NPFFO15130 113 aa1.66□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 COPZ1P61923 177 aa1.66□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 MPV17LQ2QL34 196 aa1.66□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 SMIM7Q9BQ49 75 aa1.66□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC35B3Q9H1N7 401 aa1.66□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa1.66□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 URB1O60287 2271 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 WNK1Q9H4A3 2382 aa1.66□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 ATMQ13315 3056 aa1.66□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 DCHS2Q6V1P9 2916 aa1.66□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 MYO7AQ13402 2215 aa1.66□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 BSNQ9UPA5 3926 aa1.65□□□□□ -2.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa1.65□□□□□ -2.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa1.65□□□□□ -2.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 A6NN06 94 aa1.65□□□□□ -2.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 K7EP13 123 aa1.65□□□□□ -2.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 NUPR1O60356 82 aa1.65□□□□□ -2.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa1.65□□□□□ -2.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 LIMD2Q9BT23 127 aa1.65□□□□□ -2.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZFP30Q9Y2G7 519 aa1.65□□□□□ -2.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 PATJQ8NI35 1801 aa1.65□□□□□ -2.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 MYH10P35580 1976 aa1.65□□□□□ -2.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms