RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398743.6

PRAME-202, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-202ENST00000398743 RS1O15537 224 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-202ENST00000398743 DNAJC30Q96LL9 226 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-202ENST00000398743 Q9UF83 564 aa10.04□□□□□ -0.8
PRAME-202ENST00000398743 SONP18583 2426 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PRAME-202ENST00000398743 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PRAME-202ENST00000398743 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-202ENST00000398743 TMEM223A0PJW6 202 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-202ENST00000398743 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PRAME-202ENST00000398743 AZU1P20160 251 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-202ENST00000398743 C1orf158Q8N1D5 194 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-202ENST00000398743 NF1P21359 2839 aa10.03□□□□□ -0.8
PRAME-202ENST00000398743 A0A0J9YXV3 536 aa10.02□□□□□ -0.8
PRAME-202ENST00000398743 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.8
PRAME-202ENST00000398743 CRYBA4P53673 196 aa10.02□□□□□ -0.8
PRAME-202ENST00000398743 AMELXQ99217 191 aa10.02□□□□□ -0.8
PRAME-202ENST00000398743 CCDC168Q8NDH2 2452 aa10.02□□□□□ -0.8
PRAME-202ENST00000398743 K7ERU9 68 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 LEPROTO15243 131 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 SAP30O75446 220 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 PCP4P48539 62 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 RRN3P1Q2M238 152 aa10.02□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 CHCHD7Q9BUK0 85 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 RNF151Q2KHN1 245 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 IL17DQ8TAD2 202 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 SPANXA1Q9NS26 97 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 SLC25A29Q8N8R3 303 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 FAM104AQ969W3 186 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 UBE2D1P51668 147 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 COTL1Q14019 142 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 HILS1P60008 231 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 IGHV3-30P01768 117 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 NACAE9PAV3 2078 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 IGLV1-51P01701 117 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 FAM110AQ9BQ89 295 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-202ENST00000398743 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 APOMO95445 188 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 Q6ZTI0 123 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 Q6ZUT4 128 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 VPS25Q9BRG1 176 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 F8W1H4 67 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 H3BMG7 143 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 NDUFA7O95182 113 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 K7EQD1 137 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 WFDC10AQ9H1F0 79 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.94□□□□□ -0.824e-11■□□□□ 9.7
PRAME-202ENST00000398743 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 TMEM238C9JI98 176 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 TSPAN13O95857 204 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 ITPR2Q14571 2701 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 C16orf74Q96GX8 76 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 CFC1BP0CG36 223 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 CFC1P0CG37 223 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 UNC79Q9P2D8 2635 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 G3V4G9 280 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 A0A0J9YXY3 114 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 SMR3AQ99954 134 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 GAGE13Q4V321 117 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 VSIG2Q96IQ7 327 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 ACANP16112 2415 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 WNK1Q9H4A3 2382 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms