RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 C5orf38Q86SI9 138 aa7.36□□□□□ -1.23
TTPAL-202ENST00000372904 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.36□□□□□ -1.23
TTPAL-202ENST00000372904 NACAE9PAV3 2078 aa7.36□□□□□ -1.23
TTPAL-202ENST00000372904 UBE2V1Q13404 147 aa7.36□□□□□ -1.23
TTPAL-202ENST00000372904 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.36□□□□□ -1.23
TTPAL-202ENST00000372904 Q8N2B8 174 aa7.36□□□□□ -1.23
TTPAL-202ENST00000372904 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.36□□□□□ -1.23
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.36□□□□□ -1.23
TTPAL-202ENST00000372904 AMTNQ6UX39 209 aa7.35□□□□□ -1.23
TTPAL-202ENST00000372904 RS1O15537 224 aa7.35□□□□□ -1.23
TTPAL-202ENST00000372904 Q9H8V8 135 aa7.35□□□□□ -1.23
TTPAL-202ENST00000372904 CNFNQ9BYD5 112 aa7.35□□□□□ -1.23
TTPAL-202ENST00000372904 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.35□□□□□ -1.23
TTPAL-202ENST00000372904 PSCAO43653 123 aa7.35□□□□□ -1.23
TTPAL-202ENST00000372904 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.35□□□□□ -1.23
TTPAL-202ENST00000372904 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa7.35□□□□□ -1.23
TTPAL-202ENST00000372904 NXPH4O95158 308 aa7.34□□□□□ -1.23
TTPAL-202ENST00000372904 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TTPAL-202ENST00000372904 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.34□□□□□ -1.23
TTPAL-202ENST00000372904 A0A1B0GV72 72 aa7.34□□□□□ -1.23
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.33□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 CRYGDP07320 174 aa7.33□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.33□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 MTURNQ8N3F0 131 aa7.33□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 TAL2Q16559 108 aa7.33□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 NPSP0C0P6 89 aa7.33□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 C12orf74Q32Q52 190 aa7.33□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.33□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.33□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.33□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.33□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 E9PLD3 99 aa7.32□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 A0A096LNT2 108 aa7.32□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.32□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 TSHBP01222 138 aa7.32□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 IGLV1-51P01701 117 aa7.32□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 ATXN8Q156A1 80 aa7.32□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 DAND5Q8N907 189 aa7.32□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 UBE2WQ96B02 151 aa7.32□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 PRO0255Q9UI72 69 aa7.32□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.32□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.32□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.32□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 Q9HAA7 133 aa7.32□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC168Q8NDH2 2452 aa7.32□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 FSHBP01225 129 aa7.31□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.31□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.31□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 A0A1W2PPM0 123 aa7.31□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.31□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.31□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 FXYD2P54710 66 aa7.31□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.3□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 CREBBPQ92793 2442 aa7.3□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.3□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.3□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.3□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.3□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 LYRM9A8MSI8 78 aa7.3□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 COX7B2Q8TF08 81 aa7.3□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.3□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 K7EP34 96 aa7.29□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.29□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.29□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.29□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 Q8N976 141 aa7.29□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 C9JAW5 83 aa7.29□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 PRSS47A8MTI9 375 aa7.28□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 NFE4Q86UQ8 179 aa7.28□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 SLC25A20O43772 301 aa7.28□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.28□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.28□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 COX7A2LO14548 114 aa7.28□□□□□ -1.24
TTPAL-202ENST00000372904 C2orf82Q6UX34 121 aa7.27□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.27□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 NOTCH2Q04721 2471 aa7.27□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.27□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.27□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 CCL25O15444 150 aa7.27□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 HIGD1BQ9P298 99 aa7.27□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 KLK12Q9UKR0 248 aa7.27□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.26□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.26□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.26□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 H3BMG7 143 aa7.26□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 KLK9Q2XQG4 91 aa7.26□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 MIFP14174 115 aa7.26□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 Q6ZSN1 163 aa7.26□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM223A0PJW6 202 aa7.26□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 HERV-K104P63124 156 aa7.26□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.26□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 A4D1N5 150 aa7.26□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 TAX1BP3O14907 124 aa7.25□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.25□□□□□ -1.25
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms