RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365490.1

RN7SKP249-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 249, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP249, Length 355 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP249-201ENST00000365490 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.73□□□□□ -1.33
RN7SKP249-201ENST00000365490 ESDP10768 282 aa6.73□□□□□ -1.33
RN7SKP249-201ENST00000365490 LINC00310P59036 64 aa6.73□□□□□ -1.33
RN7SKP249-201ENST00000365490 RAB5BP61020 215 aa6.73□□□□□ -1.33
RN7SKP249-201ENST00000365490 COTL1Q14019 142 aa6.73□□□□□ -1.33
RN7SKP249-201ENST00000365490 ESRGQ1W209 222 aa6.73□□□□□ -1.33
RN7SKP249-201ENST00000365490 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RN7SKP249-201ENST00000365490 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.73□□□□□ -1.33
RN7SKP249-201ENST00000365490 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.72□□□□□ -1.33
RN7SKP249-201ENST00000365490 C3orf84H3BNL1 204 aa6.72□□□□□ -1.33
RN7SKP249-201ENST00000365490 LAGE3Q14657 143 aa6.72□□□□□ -1.33
RN7SKP249-201ENST00000365490 LELP1Q5T871 98 aa6.72□□□□□ -1.33
RN7SKP249-201ENST00000365490 BAGE3Q86Y29 109 aa6.72□□□□□ -1.33
RN7SKP249-201ENST00000365490 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.72□□□□□ -1.33
RN7SKP249-201ENST00000365490 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.72□□□□□ -1.33
RN7SKP249-201ENST00000365490 TENM2Q9NT68 2774 aa6.72□□□□□ -1.33
RN7SKP249-201ENST00000365490 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RN7SKP249-201ENST00000365490 NUPR1O60356 82 aa6.71□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.71□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.71□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 FA2HQ7L5A8 372 aa6.71□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 H7C423 109 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 SERF1AO75920 110 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 G0S2P27469 103 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 FCER1GP30273 86 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 AMTP48728 403 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 NDUFA6P56556 154 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 CASC10Q5T4H9 136 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 A0A096LNJ9 63 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 CCL18P55774 89 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 UPK3BQ9BT76 320 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 TMEM243Q9BU79 118 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 LINC01549A6NIU2 74 aa6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.67□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 A0A1B0GUV1 79 aa6.67□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 IGIPA6NJ69 53 aa6.67□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 HSBP1O75506 76 aa6.67□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.67□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 TOMM6Q96B49 74 aa6.67□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.67□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 C5orf52A6NGY3 159 aa6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 HBDP02042 147 aa6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 S100A6P06703 90 aa6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 NPSP0C0P6 89 aa6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 PKIAP61925 76 aa6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 FAM104AQ969W3 186 aa6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 TMEM18Q96B42 140 aa6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.66□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.65□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 FGF6P10767 208 aa6.65□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 GAGE6Q13070 117 aa6.65□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 PMCHL1Q16048 86 aa6.65□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.65□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.65□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 ERASQ7Z444 233 aa6.65□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.65□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.65□□□□□ -1.34
RN7SKP249-201ENST00000365490 UBE2L6O14933 153 aa6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 RBX1P62877 108 aa6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 TIMM17AQ99595 171 aa6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 IFITM10A6NMD0 228 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 TMEM262E9PQX1 116 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 K7EP13 123 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 SIVA1O15304 175 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 MPV17L2Q567V2 206 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 TMEM141Q96I45 108 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 Q9H8V8 135 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.62□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 A0A087WX48 190 aa6.62□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 ATP5LO75964 103 aa6.62□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.62□□□□□ -1.35
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms