RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 RASL11AQ6T310 242 aa5.15□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.15□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 NUP35Q8NFH5 326 aa5.15□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 IMMP2LQ96T52 175 aa5.15□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 Q9HAA7 133 aa5.15□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 FAT1Q14517 4588 aa5.15□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 M0QY20 66 aa5.14□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 ADCYAP1P18509 176 aa5.14□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2D3P61077 147 aa5.14□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2D2P62837 147 aa5.14□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 HBBP68871 147 aa5.14□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 LAGE3Q14657 143 aa5.14□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 RHEBQ15382 184 aa5.14□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.14□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 Q8N3U1 123 aa5.14□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 MRAP2Q96G30 205 aa5.14□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 BTF3L4Q96K17 158 aa5.14□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5.14□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.14□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 NIT2Q9NQR4 276 aa5.14□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa5.14□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.14□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa5.13□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 S100PP25815 95 aa5.13□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 ELOBQ15370 118 aa5.13□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 C10orf91Q5T1B1 145 aa5.13□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 SVBPQ8N300 66 aa5.13□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.13□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM242Q9NWH2 141 aa5.13□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
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SGMS1-201ENST00000361543 A0A087WX48 190 aa5.12□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.12□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.12□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 TCAPO15273 167 aa5.12□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 PPBPP02775 128 aa5.12□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.11□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.11□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.11□□□□□ -1.59
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SGMS1-201ENST00000361543 CAMPP49913 170 aa5.11□□□□□ -1.59
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SGMS1-201ENST00000361543 NIT1Q86X76 327 aa5.11□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa5.11□□□□□ -1.59
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SGMS1-201ENST00000361543 SVIPQ8NHG7 77 aa5.11□□□□□ -1.59
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SGMS1-201ENST00000361543 ST20Q9HBF5 79 aa5.11□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 MYCBP2O75592 4640 aa5.11□□□□□ -1.59
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SGMS1-201ENST00000361543 COX11Q9Y6N1 276 aa5.1□□□□□ -1.59
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SGMS1-201ENST00000361543 H7C423 109 aa5.09□□□□□ -1.59
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SGMS1-201ENST00000361543 Q0VG73 95 aa5.08□□□□□ -1.6
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SGMS1-201ENST00000361543 UBE2WQ96B02 151 aa5.08□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 RNF185Q96GF1 192 aa5.08□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 RPS10P5Q9NQ39 176 aa5.08□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 KLK12Q9UKR0 248 aa5.08□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.08□□□□□ -1.6
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