RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 SEC11AP67812 179 aa8.09□□□□□ -1.11
PGA3-201ENST00000325558 Q6ZVH6 145 aa8.09□□□□□ -1.11
PGA3-201ENST00000325558 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.09□□□□□ -1.11
PGA3-201ENST00000325558 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.09□□□□□ -1.11
PGA3-201ENST00000325558 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.09□□□□□ -1.11
PGA3-201ENST00000325558 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.09□□□□□ -1.11
PGA3-201ENST00000325558 Q6ZTI0 123 aa8.09□□□□□ -1.11
PGA3-201ENST00000325558 ZNF479Q96JC4 524 aa8.09□□□□□ -1.11
PGA3-201ENST00000325558 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PGA3-201ENST00000325558 NOTCH2Q04721 2471 aa8.08□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.08□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.08□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 C16orf74Q96GX8 76 aa8.08□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 TM2D2Q9BX73 214 aa8.08□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.07□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 CIDEAO60543 219 aa8.07□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 PF4P02776 101 aa8.07□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.07□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.07□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.06□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 WIPF1O43516 503 aa8.06□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 TAL2Q16559 108 aa8.06□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.06□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.06□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.06□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.06□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.06□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.06□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.05□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.05□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 OR11H2Q8NH07 326 aa8.05□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.05□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.05□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 JMJD1CQ15652 2540 aa8.05□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 H3BRM9 83 aa8.04□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 UBE2D3P61077 147 aa8.04□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 UBE2D2P62837 147 aa8.04□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.04□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.04□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 TMEM223A0PJW6 202 aa8.03□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 K7EQD1 137 aa8.03□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 EMP1P54849 157 aa8.03□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 RRN3P1Q2M238 152 aa8.03□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.03□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 VCX2Q9H322 139 aa8.03□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 X6R8D5 127 aa8.03□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 FXYD2P54710 66 aa8.03□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.03□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 CEND1Q8N111 149 aa8.03□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.03□□□□□ -1.12
PGA3-201ENST00000325558 A0A0J9YXV3 536 aa8.02□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.02□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 LINC00694P0DN24 101 aa8.02□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 UBE2V1Q13404 147 aa8.02□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 COTL1Q14019 142 aa8.02□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 FHL2Q14192 279 aa8.02□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.02□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.02□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.01□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 A6NDN8 102 aa8.01□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.01□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 K7EP13 123 aa8.01□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 CCL25O15444 150 aa8.01□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.01□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 A0A1B0GWB2 263 aa8□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 C9orf118A6NHY6 69 aa8□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 A0A0J9YY99 117 aa8□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 GAGE12BA1L429 117 aa8□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 LEPROTO15243 131 aa8□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 GAGE7O76087 117 aa8□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 GAGE12FP0CL80 117 aa8□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 GAGE12GP0CL81 117 aa8□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 GAGE12IP0CL82 117 aa8□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 HERVK_113P61574 105 aa8□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 ZNF815PA8K554 130 aa7.99□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 Q6ZUT4 128 aa7.99□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 VWFP04275 2813 aa7.99□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 J3QQQ9 107 aa7.98□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 GCSHP23434 173 aa7.98□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 UBE2D1P51668 147 aa7.98□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 TIRAPP58753 221 aa7.98□□□□□ -1.13
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