RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295645.8

PDCL2-201, Transcript of phosducin like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL2, Length 861 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2-201ENST00000295645 PTPN23Q9H3S7 1636 aa0□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 TMEM14BQ9NUH8 114 aa0□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa0□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa0□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 IQGAP1P46940 1657 aa-0.01□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-0.01□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 NHSL1Q5SYE7 1610 aa-0.01□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa-0.01□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 ERCC6L2Q5T890 1561 aa-0.01□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa-0.01□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 H3BMG7 143 aa-0.01□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 KLKP1Q107X0 134 aa-0.01□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 LYPD5Q6UWN5 251 aa-0.01□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 CARD19Q96LW7 228 aa-0.01□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 DSCR8Q96T75 97 aa-0.01□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 TAF9BQ9HBM6 251 aa-0.01□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 PROK2Q9HC23 129 aa-0.01□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 GID8Q9NWU2 228 aa-0.01□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 ATPIF1Q9UII2 106 aa-0.01□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 ABCA6Q8N139 1617 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 KDM5CP41229 1560 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 SMARCA2P51531 1590 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 BICRAQ9NZM4 1560 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 IFNA21P01568 189 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 APOC1P02654 83 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 MT4P47944 62 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 MORN4Q8NDC4 146 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 ATG5Q9H1Y0 275 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 COA4Q9NYJ1 87 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 FKBP11Q9NYL4 201 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 COMMD3Q9UBI1 195 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 PIK3C2BO00750 1634 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 KIF21BO75037 1637 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 TOP2BQ02880 1626 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 PREX2Q70Z35 1606 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 MROH1Q8NDA8 1641 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 ADGRB1O14514 1584 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 ARHGEF5Q12774 1597 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 A0A096LNT2 108 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 H7BYZ3 331 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 SLC25A4P12235 298 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 IL7P13232 177 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 CRYGSP22914 178 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 CKS2P33552 79 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 CRYBA4P53673 196 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 TMEM78Q5T7P6 136 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 STX12Q86Y82 276 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 TEX29Q8N6K0 151 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 OR51A4Q8NGJ6 313 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 FAM213BQ8TBF2 198 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 VPS25Q9BRG1 176 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 PRR15LQ9BU68 103 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 ABCA9Q8IUA7 1624 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 ADCY10Q96PN6 1610 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 SSC5DA1L4H1 1573 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 GLI2P10070 1586 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 ADAMTS12P58397 1594 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 PEG3Q9GZU2 1588 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 HMGXB3Q12766 1538 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 A2MP01023 1474 aa-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
PDCL2-201ENST00000295645 CLTCL1P53675 1640 aa-0.04□□□□□ -2.42
PDCL2-201ENST00000295645 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa-0.04□□□□□ -2.42
PDCL2-201ENST00000295645 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa-0.04□□□□□ -2.42
PDCL2-201ENST00000295645 TMEM238C9JI98 176 aa-0.04□□□□□ -2.42
PDCL2-201ENST00000295645 SPRR2DP22532 72 aa-0.04□□□□□ -2.42
PDCL2-201ENST00000295645 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
PDCL2-201ENST00000295645 BLCAPP62952 87 aa-0.04□□□□□ -2.42
PDCL2-201ENST00000295645 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-0.04□□□□□ -2.42
PDCL2-201ENST00000295645 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.04□□□□□ -2.42
PDCL2-201ENST00000295645 PCBD2Q9H0N5 130 aa-0.04□□□□□ -2.42
PDCL2-201ENST00000295645 MED31Q9Y3C7 131 aa-0.04□□□□□ -2.42
PDCL2-201ENST00000295645 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
PDCL2-201ENST00000295645 DIP2AQ14689 1571 aa-0.04□□□□□ -2.42
PDCL2-201ENST00000295645 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa-0.04□□□□□ -2.42
PDCL2-201ENST00000295645 MED14O60244 1454 aa-0.04□□□□□ -2.42
PDCL2-201ENST00000295645 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
PDCL2-201ENST00000295645 FAM135BQ49AJ0 1406 aa-0.04□□□□□ -2.42
PDCL2-201ENST00000295645 LRRC37A3O60309 1634 aa-0.05□□□□□ -2.42
PDCL2-201ENST00000295645 IQGAP3Q86VI3 1631 aa-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.5 ms