RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 SFRP2Q96HF1 295 aa6.56□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.55□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.55□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.55□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 UBE2D3P61077 147 aa6.55□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 UBE2D2P62837 147 aa6.55□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 MPV17L2Q567V2 206 aa6.55□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.55□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 JPT2Q9H910 190 aa6.55□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 OSTCQ9NRP0 149 aa6.55□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.55□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 PRR34Q9NV39 138 aa6.55□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 IL36BQ9NZH7 164 aa6.55□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.55□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 LPAP08519 4548 aa6.55□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 COLCA2A8K830 154 aa6.54□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 LTAP01374 205 aa6.54□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 CHTF8P0CG12 524 aa6.54□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 GNG5P63218 68 aa6.54□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 CT83Q5H943 113 aa6.54□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.54□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.54□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 Q86TA4 180 aa6.54□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 BAGE2Q86Y30 109 aa6.54□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.54□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 OCC1Q8TAD7 63 aa6.54□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 SGK494Q96LW2 274 aa6.54□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 YPEL4Q96NS1 127 aa6.54□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 hDV102S1A0JD36 115 aa6.53□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 COX19Q49B96 90 aa6.53□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.53□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 GTSF1Q8WW33 167 aa6.53□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 MLST8Q9BVC4 326 aa6.53□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 PSG8Q9UQ74 426 aa6.53□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 A0A087WWL8 130 aa6.52□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.52□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 K7EN84 100 aa6.52□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 RAB5AP20339 215 aa6.52□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.52□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.52□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.51□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 RAB5BP61020 215 aa6.51□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.51□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 DNLZQ5SXM8 178 aa6.51□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 V9GYV3 84 aa6.51□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.5□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 FAM231BA6NCW3 169 aa6.5□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.5□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 H3BVH4 76 aa6.5□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 P01737 135 aa6.5□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.5□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 GZMBP10144 247 aa6.5□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 RASL11AQ6T310 242 aa6.5□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 PRNTQ86SH4 94 aa6.5□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.5□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.5□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.49□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 SLPIP03973 132 aa6.49□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 RBX1P62877 108 aa6.49□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.49□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.49□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.48□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.48□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 XKRY2A2RUG3 117 aa6.48□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.48□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 MT-ND6P03923 174 aa6.48□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 RAB4BP61018 213 aa6.48□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 COX6A2Q02221 97 aa6.48□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 REG3AQ06141 175 aa6.48□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 MAJINQ3KP22 176 aa6.48□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.48□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 STPG4Q8N801 248 aa6.48□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 TSKUQ8WUA8 353 aa6.48□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 MUC2Q02817 5179 aa6.47□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.47□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 A8MWL6 223 aa6.47□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 CXCL1P09341 107 aa6.47□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 ZFP82Q8N141 532 aa6.47□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.47□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.47□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 NUDT11Q96G61 164 aa6.47□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.47□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.47□□□□□ -1.37
USP41-201ENST00000292729 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.46□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 H7C1H1 209 aa6.46□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 M0R381 172 aa6.46□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.46□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 PRR27Q6MZM9 219 aa6.46□□□□□ -1.38
USP41-201ENST00000292729 CFAP161Q6P656 301 aa6.46□□□□□ -1.38
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