RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 CFAP161Q6P656 301 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 CARD19Q96LW7 228 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-33P01772 117 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 UBE2D3P61077 147 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 UBE2D2P62837 147 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 Q9H8V8 135 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 B5MCH6 92 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 AVPP01185 164 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 M0QXV9 152 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 SS18Q15532 418 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 NRGNQ92686 78 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 NDUFA1O15239 70 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZUT4 128 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 AMELXQ99217 191 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 GAGE7O76087 117 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 GAGE12FP0CL80 117 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 GAGE12GP0CL81 117 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 GAGE12IP0CL82 117 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 EDN2P20800 178 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 RNF183Q96D59 192 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 USP34Q70CQ2 3546 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 MALP21145 153 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 ZNF575Q86XF7 245 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 COX7B2Q8TF08 81 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 GHRHP01286 108 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 GAGE6Q13070 117 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 PAX4O43316 350 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 Q8N2B8 174 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 H0YGX0 51 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 TRIAP1O43715 76 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 PROK1P58294 105 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 COX7A2LO14548 114 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZSV7 163 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 A0A0C4DFX4 3053 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 PRO0461Q9UI25 63 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 CDH23Q9H251 3354 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 EYSQ5T1H1 3165 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 C3orf56Q8N813 242 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 DEFB130BP0DP73 79 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 DEFB130AP0DP74 79 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 LST1O00453 97 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 TRACP01848 142 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 MT-ATP8P03928 68 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZTI0 123 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 CLEC2BQ92478 149 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 APOC4P55056 127 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 A8MTW9 85 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 DAND5Q8N907 189 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 SPG11Q96JI7 2443 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 FSHBP01225 129 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 PRB1P04280 392 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 INSL3P51460 131 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 CXCL5P42830 114 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 HTN3P15516 51 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 Q6Q795 121 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.4□□□□□ -1.38
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