RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 LINC00310P59036 64 aa7.59□□□□□ -1.19
TTPAL-201ENST00000262605 HERVK_113P63121 156 aa7.59□□□□□ -1.19
TTPAL-201ENST00000262605 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.59□□□□□ -1.19
TTPAL-201ENST00000262605 C16orf95Q9H693 158 aa7.59□□□□□ -1.19
TTPAL-201ENST00000262605 A0A1B0GV72 72 aa7.59□□□□□ -1.19
TTPAL-201ENST00000262605 M0QY20 66 aa7.59□□□□□ -1.19
TTPAL-201ENST00000262605 NRACQ8N912 160 aa7.59□□□□□ -1.19
TTPAL-201ENST00000262605 C11orf86A6NJI1 115 aa7.58□□□□□ -1.2
TTPAL-201ENST00000262605 NXPH4O95158 308 aa7.58□□□□□ -1.2
TTPAL-201ENST00000262605 CEND1Q8N111 149 aa7.58□□□□□ -1.2
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TTPAL-201ENST00000262605 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
TTPAL-201ENST00000262605 PSCAO43653 123 aa7.58□□□□□ -1.2
TTPAL-201ENST00000262605 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
TTPAL-201ENST00000262605 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
TTPAL-201ENST00000262605 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.58□□□□□ -1.2
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TTPAL-201ENST00000262605 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.57□□□□□ -1.2
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TTPAL-201ENST00000262605 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.57□□□□□ -1.2
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TTPAL-201ENST00000262605 ZNF580Q9UK33 172 aa7.57□□□□□ -1.2
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TTPAL-201ENST00000262605 A0A096LNT2 108 aa7.56□□□□□ -1.2
TTPAL-201ENST00000262605 Q8N2B8 174 aa7.56□□□□□ -1.2
TTPAL-201ENST00000262605 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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TTPAL-201ENST00000262605 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.56□□□□□ -1.2
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TTPAL-201ENST00000262605 UBE2WQ96B02 151 aa7.56□□□□□ -1.2
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TTPAL-201ENST00000262605 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.55□□□□□ -1.2
TTPAL-201ENST00000262605 IGLV1-51P01701 117 aa7.55□□□□□ -1.2
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TTPAL-201ENST00000262605 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.54□□□□□ -1.2
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TTPAL-201ENST00000262605 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.53□□□□□ -1.2
TTPAL-201ENST00000262605 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
TTPAL-201ENST00000262605 C9orf118A6NHY6 69 aa7.52□□□□□ -1.21
TTPAL-201ENST00000262605 SIVA1O15304 175 aa7.52□□□□□ -1.21
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TTPAL-201ENST00000262605 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.52□□□□□ -1.21
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TTPAL-201ENST00000262605 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.51□□□□□ -1.21
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TTPAL-201ENST00000262605 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.51□□□□□ -1.21
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TTPAL-201ENST00000262605 AGRNO00468 2067 aa7.5□□□□□ -1.21
TTPAL-201ENST00000262605 IGLL5B9A064 214 aa7.5□□□□□ -1.21
TTPAL-201ENST00000262605 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.5□□□□□ -1.21
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TTPAL-201ENST00000262605 Q6ZSN1 163 aa7.49□□□□□ -1.21
TTPAL-201ENST00000262605 JMJD1CQ15652 2540 aa7.49□□□□□ -1.21
TTPAL-201ENST00000262605 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.49□□□□□ -1.21
TTPAL-201ENST00000262605 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.49□□□□□ -1.21
TTPAL-201ENST00000262605 CCL25O15444 150 aa7.49□□□□□ -1.21
TTPAL-201ENST00000262605 LYRM9A8MSI8 78 aa7.49□□□□□ -1.21
TTPAL-201ENST00000262605 COX7B2Q8TF08 81 aa7.49□□□□□ -1.21
TTPAL-201ENST00000262605 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.48□□□□□ -1.21
TTPAL-201ENST00000262605 Q8N976 141 aa7.48□□□□□ -1.21
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