RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 CRYGDP07320 174 aa19.36■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2D3P61077 147 aa19.36■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2D2P62837 147 aa19.36■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 SMAGPQ0VAQ4 97 aa19.36■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf86A6NJI1 115 aa19.35■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 KLLNB2CW77 178 aa19.35■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00315P59091 139 aa19.35■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 CD7P09564 240 aa19.35■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFP2Q6ZN57 461 aa19.35■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa19.34■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa19.34■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 GNRH2O43555 120 aa19.34■□□□□ 0.69
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CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa19.3■□□□□ 0.68
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CAPNS1-201ENST00000246533 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa19.27■□□□□ 0.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa19.26■□□□□ 0.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 F6UB75 175 aa19.25■□□□□ 0.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB1P60022 68 aa19.21■□□□□ 0.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 CFC1P0CG37 223 aa19.2■□□□□ 0.66
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CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB114Q30KQ6 69 aa19.19■□□□□ 0.66
CAPNS1-201ENST00000246533 TGP01266 2768 aa19.19■□□□□ 0.66
CAPNS1-201ENST00000246533 A8MWV9 139 aa19.19■□□□□ 0.66
CAPNS1-201ENST00000246533 K7EIL1 84 aa19.19■□□□□ 0.66
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
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CAPNS1-201ENST00000246533 A0A087WWL8 130 aa19.15■□□□□ 0.66
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CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa19.13■□□□□ 0.65
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa19.13■□□□□ 0.65
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
CAPNS1-201ENST00000246533 EMP1P54849 157 aa19.13■□□□□ 0.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SCGB1C2P0DMR2 95 aa19.12■□□□□ 0.65
CAPNS1-201ENST00000246533 P0DMU3 169 aa19.12■□□□□ 0.65
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM231AP0DMU4 169 aa19.12■□□□□ 0.65
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