RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 RBX1P62877 108 aa14.84□□□□□ -0.03
SYF2-201ENST00000236273 HBBP68871 147 aa14.84□□□□□ -0.03
SYF2-201ENST00000236273 COTL1Q14019 142 aa14.84□□□□□ -0.03
SYF2-201ENST00000236273 ENHOQ6UWT2 76 aa14.84□□□□□ -0.03
SYF2-201ENST00000236273 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.83□□□□□ -0.04
SYF2-201ENST00000236273 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa14.83□□□□□ -0.04
SYF2-201ENST00000236273 TMEM243Q9BU79 118 aa14.83□□□□□ -0.04
SYF2-201ENST00000236273 TMEM70Q9BUB7 260 aa14.83□□□□□ -0.04
SYF2-201ENST00000236273 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa14.82□□□□□ -0.04
SYF2-201ENST00000236273 ST20Q9HBF5 79 aa14.82□□□□□ -0.04
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SYF2-201ENST00000236273 I3L3M4 83 aa14.8□□□□□ -0.04
SYF2-201ENST00000236273 AMTP48728 403 aa14.8□□□□□ -0.04
SYF2-201ENST00000236273 C20orf203Q8NBC4 194 aa14.8□□□□□ -0.04
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SYF2-201ENST00000236273 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa14.79□□□□□ -0.04
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GUV1 79 aa14.79□□□□□ -0.04
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SYF2-201ENST00000236273 ANGP03950 147 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SYF2-201ENST00000236273 PRR34Q9NV39 138 aa14.79□□□□□ -0.04
SYF2-201ENST00000236273 S100A8P05109 93 aa14.78□□□□□ -0.04
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SYF2-201ENST00000236273 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
SYF2-201ENST00000236273 TM2D2Q9BX73 214 aa14.78□□□□□ -0.04
SYF2-201ENST00000236273 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
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SYF2-201ENST00000236273 WFDC2Q14508 124 aa14.77□□□□□ -0.04
SYF2-201ENST00000236273 IMMP2LQ96T52 175 aa14.77□□□□□ -0.04
SYF2-201ENST00000236273 CTDSP1Q9GZU7 261 aa14.77□□□□□ -0.04
SYF2-201ENST00000236273 ESDP10768 282 aa14.76□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 Q0VG73 95 aa14.76□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 LINC00269Q8N2A0 174 aa14.76□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 HERC2O95714 4834 aa14.76□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R17O96001 155 aa14.75□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 CKS2P33552 79 aa14.75□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 TMEM242Q9NWH2 141 aa14.75□□□□□ -0.05
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SYF2-201ENST00000236273 RYR1P21817 5038 aa14.74□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 C16orf90A8MZG2 172 aa14.74□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 D6R8Y8 96 aa14.74□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 VCYO14598 125 aa14.74□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 APCSP02743 223 aa14.74□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 BTF3L4Q96K17 158 aa14.74□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa14.73□□□□□ -0.05
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SYF2-201ENST00000236273 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa14.73□□□□□ -0.05
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SYF2-201ENST00000236273 C20orf78Q9BR46 151 aa14.72□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 H7C423 109 aa14.71□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 NPYP01303 97 aa14.71□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 RPL32P62910 135 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
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SYF2-201ENST00000236273 Q8N814 137 aa14.71□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 CLRN3Q8NCR9 226 aa14.71□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 BAALCQ8WXS3 180 aa14.71□□□□□ -0.05
SYF2-201ENST00000236273 CRPP02741 224 aa14.7□□□□□ -0.06
SYF2-201ENST00000236273 PPBPP02775 128 aa14.7□□□□□ -0.06
SYF2-201ENST00000236273 REG3AQ06141 175 aa14.7□□□□□ -0.06
SYF2-201ENST00000236273 FGF6P10767 208 aa14.69□□□□□ -0.06
SYF2-201ENST00000236273 TMEM136Q6ZRR5 245 aa14.69□□□□□ -0.06
SYF2-201ENST00000236273 C1orf43Q9BWL3 253 aa14.69□□□□□ -0.06
SYF2-201ENST00000236273 PHOX2AO14813 284 aa14.68□□□□□ -0.06
SYF2-201ENST00000236273 LECT2O14960 151 aa14.68□□□□□ -0.06
SYF2-201ENST00000236273 HSPG2P98160 4391 aa14.68□□□□□ -0.06
SYF2-201ENST00000236273 CDPF1Q6NVV7 123 aa14.67□□□□□ -0.06
SYF2-201ENST00000236273 ORMDL3Q8N138 153 aa14.67□□□□□ -0.06
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SYF2-201ENST00000236273 DNAH8Q96JB1 4490 aa14.66□□□□□ -0.06
SYF2-201ENST00000236273 PRSS47A8MTI9 375 aa14.66□□□□□ -0.06
SYF2-201ENST00000236273 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SYF2-201ENST00000236273 KIR2DL4Q99706 377 aa14.66□□□□□ -0.06
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SYF2-201ENST00000236273 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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SYF2-201ENST00000236273 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SYF2-201ENST00000236273 FCER1GP30273 86 aa14.64□□□□□ -0.07
SYF2-201ENST00000236273 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa14.63□□□□□ -0.07
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP10-1P60331 282 aa14.63□□□□□ -0.07
SYF2-201ENST00000236273 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SYF2-201ENST00000236273 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa14.62□□□□□ -0.07
SYF2-201ENST00000236273 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa14.61□□□□□ -0.07
SYF2-201ENST00000236273 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa14.61□□□□□ -0.07
SYF2-201ENST00000236273 TCAPO15273 167 aa14.6□□□□□ -0.07
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