RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 LEPROTO15243 131 aa15.26■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 Q1RN00 199 aa15.26■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 C19orf54Q5BKX5 351 aa15.26■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 ODF3Q96PU9 254 aa15.26■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 EDN2P20800 178 aa15.25■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa15.24■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 IGHV3-11P01762 117 aa15.24■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 ADORA2A-AS1P86434 159 aa15.24■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 TRIAP1O43715 76 aa15.23■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 FAM223BA6NKX1 122 aa15.23■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 KLLNB2CW77 178 aa15.23■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 FAM159AQ6UWV7 190 aa15.23■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 FAM223AQ8IWN6 122 aa15.23■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 FLNCQ14315 2725 aa15.22■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa15.22■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 A0A0J9YXV3 536 aa15.22■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 LGALS9O00182 355 aa15.22■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 ATXN8Q156A1 80 aa15.22■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa15.22■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 NDUFA4O00483 81 aa15.22■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 PRB1P04280 392 aa15.22■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 M0R2P5 195 aa15.21■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa15.21■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 MYO18BQ8IUG5 2567 aa15.21■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 AKAP6Q13023 2319 aa15.21■□□□□ 0.03
PMS1-222ENST00000639501 A0A0J9YXY3 114 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 A0A1W2PPR1 153 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 GNLYP22749 145 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 NPFFO15130 113 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 IGHV1-69P01742 117 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 ZNF56Q15929 161 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 M0QY20 66 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 Q6ZSV7 163 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 MDFICQ9P1T7 246 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 IFITM1P13164 125 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 C15orf53Q8NAA6 179 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 LITAFQ99732 161 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 ZNF462Q96JM2 2506 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa15.18■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 GAGE12JA6NER3 117 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 GAGE7O76087 117 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 GAGE12FP0CL80 117 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 GAGE12GP0CL81 117 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 GAGE12IP0CL82 117 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 GAGE4Q13068 117 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 TTC32Q5I0X7 151 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 H3BMM0 161 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 UBE2WQ96B02 151 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 MOB4Q9Y3A3 225 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa15.16■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa15.16■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa15.16■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 C20orf203Q8NBC4 194 aa15.16■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa15.15■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa15.15■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa15.15■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 LINC01600Q96MT4 127 aa15.15■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 SPXQ9BT56 116 aa15.15■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 RHOHQ15669 191 aa15.15■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 C9orf85Q96MD7 179 aa15.15■□□□□ 0.02
PMS1-222ENST00000639501 A0A0J9YX75 114 aa15.14■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 H7C423 109 aa15.14■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 NPC2P61916 151 aa15.14■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 Q6Q795 121 aa15.14■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 IGKV3-20P01619 116 aa15.14■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 C2orf82Q6UX34 121 aa15.14■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 CLEC2BQ92478 149 aa15.13■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 FAM104AQ969W3 186 aa15.13■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 ICOSQ9Y6W8 199 aa15.13■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 ABCA2Q9BZC7 2435 aa15.13■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 CHD6Q8TD26 2715 aa15.13■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 PRSS2P07478 247 aa15.12■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 BRD3OSQ6XYD6 125 aa15.12■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 BPESC1Q9GZL8 116 aa15.12■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 A8MZ25 164 aa15.12■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 LMO4P61968 165 aa15.12■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 UBTD1Q9HAC8 227 aa15.12■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 DCANP1Q8TF63 244 aa15.11■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 TIMM21Q9BVV7 248 aa15.11■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 PF4V1P10720 104 aa15.1■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 LY6EQ16553 131 aa15.1■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 DUX3Q96PT4 197 aa15.09■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 I3L3M4 83 aa15.08■□□□□ 0.01
PMS1-222ENST00000639501 SMIM20Q8N5G0 67 aa15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms