RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639159.1

LINC01138-208, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1138, human

TSL 5 BASIC

Gene LINC01138, Length 1,521 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01138-208	ENST00000639159	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159		K7EMT4	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	LYNX1	P0DP58	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159		Q6JHZ5	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	FAM186A	A6NE01	2351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	VCAN	P13611	3396 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159		G3V318	75 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	SPRY2	O43597	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	DNAL4	O96015	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	SVIL	O95425	2214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	ATP5J2	P56134	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	JPT2	Q9H910	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	CAD	P27708	2225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	CFAP54	Q96N23	3096 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	NDUFC2	O95298	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	MAL	P21145	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	SAA4	P35542	130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	C3orf56	Q8N813	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159		F6UB75	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159		H0YGX0	51 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	PRO3102	Q9H379	93 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	TECTA	O75443	2155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	PLCE1	Q9P212	2302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	LCE2B	O14633	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	BCE1	O60756	84 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	TRIO	O75962	3097 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	SPEG	Q15772	3267 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	CRP	P02741	224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	NPC2	P61916	151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159		Q6ZSV7	163 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159		Q9H8V8	135 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	MUC4	Q99102	2169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	IGHG2	P01859	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	KLRB1	Q12918	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	FRY	Q5TBA9	3013 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01138-208	ENST00000639159	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms