RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 DEFB135Q30KP9 77 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 RTTNQ86VV8 2226 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 SPTA1P02549 2419 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 GDF5OSQ5U4N7 250 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 SPANXCQ9NY87 97 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 IGLV2-11P01706 119 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 IGHV3-30P01768 117 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 IGHV3-33P01772 117 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 ETDBQ3ZM63 59 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 WFDC11Q8NEX6 87 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 NCOR1O75376 2440 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 A4D1N5 150 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 RS1O15537 224 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 DEFB1P60022 68 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 BRI3O95415 125 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 TPRP12270 2363 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 MED13Q9UHV7 2174 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF580Q9UK33 172 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 ACACAQ13085 2346 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 CRIP1P50238 77 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 TDRG1Q3Y452 100 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 TIRAPP58753 221 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 UBE2BP63146 152 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 C15orf53Q8NAA6 179 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 Q9HAA7 133 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 MIFP14174 115 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 MIAQ16674 131 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-228ENST00000636120 SHISA2Q6UWI4 295 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 RNF185Q96GF1 192 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 FREM1Q5H8C1 2179 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 CFAP126Q5VTH2 177 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 FXYD2P54710 66 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 Q6ZUT4 128 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 A0A0B4J2C4 111 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFA7O95182 113 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 C14orf177Q52M58 125 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 NFE4Q86UQ8 179 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 SPAG11BQ08648 103 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 TAX1BP3O14907 124 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 KLLNB2CW77 178 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 M0QY20 66 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 Q6ZTI0 123 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 SHANK1Q9Y566 2161 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 GPR179Q6PRD1 2367 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM223A0PJW6 202 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 HILS1P60008 231 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 LINC01620Q4KN68 170 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 EML5Q05BV3 1969 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 H3BT86 120 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 PLA2G2AP14555 144 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 LY6G6DO95868 133 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 HAMPP81172 84 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 A0A0J9YXY3 114 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 INAFM1C9JVW0 142 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 TEN1Q86WV5 123 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 C9orf85Q96MD7 179 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 SPATA25Q9BR10 227 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 DIRC1Q969H9 104 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 USF3Q68DE3 2245 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 NCR3O14931 201 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 CDSNQ15517 529 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 CNFNQ9BYD5 112 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 KLK12Q9UKR0 248 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 COL6A6A6NMZ7 2263 aa4.8□□□□□ -1.64
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