RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636060.1

LIN28B-AS1-202, LIN28B antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene LIN28B-AS1, Length 548 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.95□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.95□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 F5H697 171 aa6.95□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 M0QY20 66 aa6.95□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MGPP08493 103 aa6.95□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TNP2Q05952 138 aa6.95□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.95□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.95□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TSKUQ8WUA8 353 aa6.95□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.95□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.94□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FAM231BA6NCW3 169 aa6.94□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TWIST1Q15672 202 aa6.94□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 Q8N3U1 123 aa6.94□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.94□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.94□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.94□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 A0A087WWC5 75 aa6.93□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 HIGD1CA8MV81 97 aa6.93□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 K7EP13 123 aa6.93□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.92□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 H7C1H1 209 aa6.92□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IGHV3-30P01768 117 aa6.92□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IGHV3-33P01772 117 aa6.92□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.92□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.92□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RASL11AQ6T310 242 aa6.92□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 GATD1Q8NB37 220 aa6.92□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.91□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 A0A1B0GUT8 65 aa6.91□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.91□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.91□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 NIT1Q86X76 327 aa6.91□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.91□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 NUP35Q8NFH5 326 aa6.91□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.91□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PKHD1P08F94 4074 aa6.9□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.9□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.9□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 BORCS7Q96B45 105 aa6.9□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.9□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 NIT2Q9NQR4 276 aa6.9□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.9□□□□□ -1.3
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ADCYAP1P18509 176 aa6.89□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.89□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 NFE4Q86UQ8 179 aa6.89□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RNF185Q96GF1 192 aa6.89□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 GAS8-AS1O95177 125 aa6.88□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RIGQ13278 110 aa6.88□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LAGE3Q14657 143 aa6.88□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.88□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 UQCC3Q6UW78 93 aa6.88□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FRZBQ92765 325 aa6.88□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.88□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RAB4AP20338 218 aa6.87□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IQCJQ1A5X6 159 aa6.87□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 AMN1Q8IY45 258 aa6.87□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 Q9HAA7 133 aa6.87□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.86□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.86□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.86□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 A0A1B0GXF2 115 aa6.86□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TMEM218A2RU14 115 aa6.86□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LINC00862A6NCI5 91 aa6.86□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PPP1R2P9O14990 202 aa6.86□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MPV17L2Q567V2 206 aa6.86□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 COMMD7Q86VX2 200 aa6.86□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.86□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.86□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 A0A087WX48 190 aa6.85□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.85□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.85□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 KRTAP10-2P60368 255 aa6.85□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.85□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.85□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 KLK12Q9UKR0 248 aa6.85□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.85□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 A0A087WTM6 91 aa6.84□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 A0A1B0GW15 77 aa6.84□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.84□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TMEM262E9PQX1 116 aa6.84□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 F8W036 122 aa6.84□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SMKR1H3BMG3 65 aa6.84□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 NCR2O95944 276 aa6.84□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MT-ND4LP03901 98 aa6.84□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CAMPP49913 170 aa6.84□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 GAGE6Q13070 117 aa6.84□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 COTL1Q14019 142 aa6.84□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.9 ms