RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa17.39■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 DERL1Q9BUN8 251 aa17.39■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa17.38■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF726P1Q15940 193 aa17.38■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10AG1Q8NH19 301 aa17.38■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 C7orf33Q8WU49 177 aa17.38■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF185Q96GF1 192 aa17.38■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 AQP10Q96PS8 301 aa17.37■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 PHOX2AO14813 284 aa17.36■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFA3P59666 94 aa17.36■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 REG3AQ06141 175 aa17.36■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa17.35■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa17.35■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 MUC21A0A140T8X8 626 aa17.35■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 SSTP61278 116 aa17.34■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 SPANXN1Q5VSR9 72 aa17.34■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 SPACA4Q8TDM5 124 aa17.34■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 LTAP01374 205 aa17.33■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 AKR1C3P42330 323 aa17.33■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFA1P59665 94 aa17.33■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 VAX2Q9UIW0 290 aa17.33■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB5CP51148 216 aa17.32■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa17.31■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa17.31■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM17P0DL12 118 aa17.31■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 ODF1Q14990 250 aa17.31■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 CST9LP1Q5W188 147 aa17.31■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa17.31■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa17.3■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 STOML3Q8TAV4 291 aa17.3■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa17.29■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 P01737 135 aa17.29■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 IQCJQ1A5X6 159 aa17.29■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 GTSF1Q8WW33 167 aa17.29■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 PLAC8Q9NZF1 115 aa17.29■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC01600Q96MT4 127 aa17.28■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa17.27■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 SLPIP03973 132 aa17.27■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa17.27■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 ALG5Q9Y673 324 aa17.27■□□□□ 0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 CXCL1P09341 107 aa17.26■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 C20orf203Q8NBC4 194 aa17.26■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 AP1S3Q96PC3 154 aa17.26■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 TCEAL7Q9BRU2 100 aa17.26■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 SNAI2O43623 268 aa17.25■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 MGPP08493 103 aa17.24■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 MAJINQ3KP22 176 aa17.24■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR73Q6P4I2 378 aa17.24■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa17.23■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 COX6A2Q02221 97 aa17.23■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM243Q9BU79 118 aa17.23■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa17.22■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5AL1P0C617 328 aa17.22■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 GZMBP10144 247 aa17.22■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 FHITP49789 147 aa17.22■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR3P79522 188 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 GFRA4Q9GZZ7 299 aa17.22■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa17.21■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 SULT1A2P50226 295 aa17.21■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 Q5BKY6 102 aa17.21■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 LYPD6BQ8NI32 183 aa17.21■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 MED28Q9H204 178 aa17.2■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP161Q6P656 301 aa17.19■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0J9YXV3 536 aa17.18■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 H7C1H1 209 aa17.18■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2L6O14933 153 aa17.18■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 PAGE4O60829 102 aa17.18■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 HIGD2BQ4VC39 106 aa17.18■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 BAGE2Q86Y30 109 aa17.18■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 STPG4Q8N801 248 aa17.18■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 TPPP3Q9BW30 176 aa17.18■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GUV1 79 aa17.17■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 S100A9P06702 114 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS10P46783 165 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa17.16■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 GAGE12HA6NDE8 117 aa17.16■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 M0QY20 66 aa17.16■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 SUMO4Q6EEV6 95 aa17.16■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 REG3GQ6UW15 175 aa17.16■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 C15orf56Q8N910 161 aa17.16■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa17.16■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 SCO2A0A1W2PP80 73 aa17.15■□□□□ 0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 GAS8-AS1O95177 125 aa17.14■□□□□ 0.33
CAPNS1-217ENST00000629983 PFDN1O60925 122 aa17.13■□□□□ 0.33
CAPNS1-217ENST00000629983 GIPP09681 153 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
CAPNS1-217ENST00000629983 MLST8Q9BVC4 326 aa17.12■□□□□ 0.33
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GV50 99 aa17.11■□□□□ 0.33
CAPNS1-217ENST00000629983 AMTP48728 403 aa17.11■□□□□ 0.33
CAPNS1-217ENST00000629983 RASL11AQ6T310 242 aa17.1■□□□□ 0.33
CAPNS1-217ENST00000629983 SPINK6Q6UWN8 80 aa17.1■□□□□ 0.33
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP10-8P60410 259 aa17.09■□□□□ 0.33
CAPNS1-217ENST00000629983 COTL1Q14019 142 aa17.08■□□□□ 0.32
CAPNS1-217ENST00000629983 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa17.08■□□□□ 0.32
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