RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625668.2

LINC02028-223, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 2028, human

TSL 5

Gene LINC02028, Length 646 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC02028-223	ENST00000625668	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668		M0R2N4	97 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	RHOD	O00212	210 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	CIDEA	O60543	219 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	RAB14	P61106	215 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	SST	P61278	116 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	IFITM2	Q01629	132 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	RHOH	Q15669	191 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	CRYGD	P07320	174 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	MT3	P25713	68 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	CTRL	P40313	264 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	PEA15	Q15121	130 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LINC02028-223	ENST00000625668	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	CACNG7	P62955	275 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	GAGE1	Q13065	139 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	GAGE4	Q13068	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	GAGE5	Q13069	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	ADIRF	Q15847	76 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	ZNF56	Q15929	161 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668		Q6ZR54	194 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	ISOC2	Q96AB3	205 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668		Q9H8V8	135 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668		Q9UF83	564 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668		F2Z2F3	143 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	MGP	P08493	103 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668		A8MWL6	223 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	SIVA1	O15304	175 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	NTF3	P20783	257 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	EVI2A	P22794	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	LINC00315	P59091	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	RAB4B	P61018	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668		V9GYV3	84 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	RTL8C	O15255	209 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	TIRAP	P58753	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668		M0QY20	66 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	UBE2D3	P61077	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	UBE2D2	P62837	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	LELP1	Q5T871	98 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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