RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572078.1

SPNS3-202, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS3, Length 463 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-202ENST00000572078 NTF3P20783 257 aa9.49□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 S100A4P26447 101 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa9.49□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 KLLNB2CW77 178 aa9.48□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 SNAI2O43623 268 aa9.48□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 AMTP48728 403 aa9.48□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 PYY3Q5JQD4 70 aa9.48□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.48□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 FAM159AQ6UWV7 190 aa9.48□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 NIT1Q86X76 327 aa9.48□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 NAGKQ9UJ70 344 aa9.48□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 C7orf71A4D174 169 aa9.47□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 J3KRW8 73 aa9.47□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 NUPR1O60356 82 aa9.47□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 ATP5G1P05496 136 aa9.47□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 IQCJQ1A5X6 159 aa9.47□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 ORMDL3Q8N138 153 aa9.47□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.47□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa9.47□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 CBY3A6NI87 242 aa9.46□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 SCGB1D1O95968 90 aa9.46□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00614P0C842 121 aa9.46□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 CKS2P33552 79 aa9.46□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 CDKN1BP46527 198 aa9.46□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 CCL18P55774 89 aa9.46□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 KIR3DS1Q14943 382 aa9.46□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 PRR9Q5T870 116 aa9.46□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 PRELID3AQ96N28 172 aa9.46□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00310P59036 64 aa9.45□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 SSTP61278 116 aa9.45□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.45□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 FA2HQ7L5A8 372 aa9.45□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.45□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 LINC01587Q99440 93 aa9.45□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 Q9H8V8 135 aa9.45□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.45□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa9.44□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 MUC21A0A140T8X8 626 aa9.44□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 H3BVH4 76 aa9.44□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 HTN1P15515 57 aa9.44□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 MUC21Q5SSG8 566 aa9.44□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 AMN1Q8IY45 258 aa9.44□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.44□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.43□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 D6R8Y8 96 aa9.43□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.43□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 OR10AG1Q8NH19 301 aa9.43□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 MYCBP2O75592 4640 aa9.43□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.42□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 A0A0J9YY99 117 aa9.42□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 PCP4L1A6NKN8 68 aa9.42□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 ESRGQ1W209 222 aa9.42□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 TDRG1Q3Y452 100 aa9.42□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 C16orf74Q96GX8 76 aa9.42□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.42□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.41□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.41□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 PPP1R17O96001 155 aa9.41□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 KRTDAPP60985 99 aa9.41□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 SYT8Q8NBV8 401 aa9.41□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 MRAP2Q96G30 205 aa9.41□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 AP1S3Q96PC3 154 aa9.41□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 UPK3BQ9BT76 320 aa9.41□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.41□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 TSTD3H0UI37 97 aa9.4□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 GNRH2O43555 120 aa9.4□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 SMIM17P0DL12 118 aa9.4□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 BTF3P20290 206 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.4□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.4□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.4□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 MSRB1Q9NZV6 116 aa9.4□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.4□□□□□ -0.9
SPNS3-202ENST00000572078 M0R381 172 aa9.39□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 LEPROTL1O95214 131 aa9.39□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 PKIAP61925 76 aa9.39□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 RNF185Q96GF1 192 aa9.39□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 C20orf202A1L168 122 aa9.38□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 GAGE12BA1L429 117 aa9.38□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 GAGE7O76087 117 aa9.38□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 NXPH4O95158 308 aa9.38□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 GAGE12FP0CL80 117 aa9.38□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 GAGE12GP0CL81 117 aa9.38□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 GAGE12IP0CL82 117 aa9.38□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 EVI2AP22794 236 aa9.38□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00315P59091 139 aa9.38□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 TTC32Q5I0X7 151 aa9.38□□□□□ -0.91
SPNS3-202ENST00000572078 Q6ZQT7 251 aa9.38□□□□□ -0.91
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