RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561514.1

PALB2-202, Transcript of partner and localizer of BRCA2, humanhuman

TSL 5

Gene PALB2, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2-202ENST00000561514 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.96□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 J3KT08 172 aa5.96□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 CXorf1O96002 111 aa5.96□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 NTF3P20783 257 aa5.96□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 SRIP30626 198 aa5.96□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 GAGE13Q4V321 117 aa5.96□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 Q6AWC8 147 aa5.96□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.96□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 OR10G7Q8NGN6 311 aa5.96□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 GTSF1Q8WW33 167 aa5.96□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 C11orf52Q96A22 123 aa5.96□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 A0A1W2PRE2 83 aa5.95□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 FNDC10F2Z333 226 aa5.95□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 LEPROTL1O95214 131 aa5.95□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 APOMO95445 188 aa5.95□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 IFITM1P13164 125 aa5.95□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 TAS2R45P59539 299 aa5.95□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 TAL2Q16559 108 aa5.95□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 TTC32Q5I0X7 151 aa5.95□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 LINC01545Q5VT33 79 aa5.95□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 EBLN2Q6P2I7 272 aa5.95□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.95□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 SYT8Q8NBV8 401 aa5.95□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 C17orf77Q96MU5 243 aa5.95□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 A0A087X0K7 114 aa5.94□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 A0A0J9YX75 114 aa5.94□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 CST7O76096 145 aa5.94□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 DEFB1P60022 68 aa5.94□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 GAGE2BQ13066 116 aa5.94□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 PMVKQ15126 192 aa5.94□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 GAGE2EQ4V326 116 aa5.94□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 FAM222AQ5U5X8 452 aa5.94□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 AMTNQ6UX39 209 aa5.94□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 ATOH7Q8N100 152 aa5.94□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 OR10J6PQ8NGY7 276 aa5.94□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.94□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 TMEM147Q9BVK8 224 aa5.94□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 TM2D2Q9BX73 214 aa5.94□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.94□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 MUC4Q99102 2169 aa5.94□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.93□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa5.93□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 E9PLD3 99 aa5.93□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 M0R2N4 97 aa5.93□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 PAGE4O60829 102 aa5.93□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 MPDU1O75352 247 aa5.93□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 TEPPQ6URK8 271 aa5.93□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 ZNF575Q86XF7 245 aa5.93□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 THAP8Q8NA92 274 aa5.93□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 TRGV9Q99603 122 aa5.93□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.93□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 CDIP1Q9H305 208 aa5.93□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa5.92□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 PRSS46E5RG02 174 aa5.92□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 F2Z2F3 143 aa5.92□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 CDK2AP2O75956 126 aa5.92□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.92□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.92□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa5.92□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 MDFICQ9P1T7 246 aa5.92□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 V9GYV3 84 aa5.92□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.91□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 LYRM9A8MSI8 78 aa5.91□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 F6UB75 175 aa5.91□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 SYNGR2O43760 224 aa5.91□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 SNCGO76070 127 aa5.91□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 NDUFB4O95168 129 aa5.91□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 IGKV3-20P01619 116 aa5.91□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 ATP5G1P05496 136 aa5.91□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 ATP5G3P48201 142 aa5.91□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 EMP1P54849 157 aa5.91□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 FXYD7P58549 80 aa5.91□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 LYZP61626 148 aa5.91□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 RRN3P1Q2M238 152 aa5.91□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.91□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 PQLC2Q6ZP29 291 aa5.91□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa5.91□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 C20orf173Q96LM9 149 aa5.91□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 FAT1Q14517 4588 aa5.9□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa5.9□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 PLAC8L1A1L4L8 177 aa5.9□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 GGTLC3B5MD39 225 aa5.9□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 ORM1P02763 201 aa5.9□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 CSN1S1P47710 185 aa5.9□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 DAD1P61803 113 aa5.9□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 SLC38A11Q08AI6 406 aa5.9□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 VWC2Q2TAL6 325 aa5.9□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.9□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 ETDBQ3ZM63 59 aa5.9□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa5.9□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.9□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 FAM19A2Q8N3H0 131 aa5.9□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 PSENENQ9NZ42 101 aa5.9□□□□□ -1.46
PALB2-202ENST00000561514 HERC1Q15751 4861 aa5.9□□□□□ -1.47
PALB2-202ENST00000561514 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.89□□□□□ -1.47
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