RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 SCXQ7RTU7 201 aa11.41□□□□□ -0.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR10AG1Q8NH19 301 aa11.41□□□□□ -0.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 LYPD6BQ8NI32 183 aa11.41□□□□□ -0.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 TPPP3Q9BW30 176 aa11.41□□□□□ -0.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A087WWC5 75 aa11.4□□□□□ -0.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 IGLV2-8P01709 118 aa11.4□□□□□ -0.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 SSTP61278 116 aa11.4□□□□□ -0.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 Q8N3U1 123 aa11.4□□□□□ -0.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa11.4□□□□□ -0.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa11.39□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 C19orf71A6NCJ1 209 aa11.39□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 F2Z2F3 143 aa11.39□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 CEBPGP53567 150 aa11.39□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 RAB4BP61018 213 aa11.39□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF56Q15929 161 aa11.39□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 LINC01620Q4KN68 170 aa11.39□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 AP1S3Q96PC3 154 aa11.39□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa11.38□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa11.38□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 MUC21A0A140T8X8 626 aa11.38□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 F5H697 171 aa11.38□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 CACNG7P62955 275 aa11.38□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 TOR2AQ5JU69 321 aa11.38□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 BAALCQ8WXS3 180 aa11.38□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 GZMBP10144 247 aa11.37□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 OXTP01178 125 aa11.36□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 NUDT10Q8NFP7 164 aa11.36□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 OCC1Q8TAD7 63 aa11.36□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 NUDT11Q96G61 164 aa11.36□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa11.36□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 COX11Q9Y6N1 276 aa11.36□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa11.35□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 IGLC6P0CF74 106 aa11.35□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM210AQ96ND0 272 aa11.35□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 CHAC1Q9BUX1 264 aa11.35□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRGC1P0CF51 173 aa11.34□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 LINC00694P0DN24 101 aa11.34□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 Q8N976 141 aa11.34□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 RMI2Q96E14 147 aa11.34□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa11.34□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 HMCN2Q8NDA2 5059 aa11.34□□□□□ -0.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 H7C1H1 209 aa11.33□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 WDR73Q6P4I2 378 aa11.33□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 KCNIP4Q6PIL6 250 aa11.33□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 TEX261Q6UWH6 196 aa11.33□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 LYZL1Q6UWQ5 148 aa11.33□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa11.33□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 SMIM7Q9BQ49 75 aa11.33□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 K7EN84 100 aa11.32□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 Q9UF83 564 aa11.32□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa11.31□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF727A8MUV8 499 aa11.31□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 GATCO43716 136 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 MGPP08493 103 aa11.31□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 UBE2D3P61077 147 aa11.31□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 UBE2D2P62837 147 aa11.31□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR10G8Q8NGN5 311 aa11.31□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 A8MWL6 223 aa11.3□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 NTF3P20783 257 aa11.3□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 TWIST1Q15672 202 aa11.3□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM97Q5BJF2 176 aa11.3□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM231DQ6ZW35 169 aa11.3□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 SMIM15Q7Z3B0 74 aa11.3□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 SRP19P09132 144 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 CTRLP40313 264 aa11.29□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 PEA15Q15121 130 aa11.29□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM74A3Q4VXF1 159 aa11.29□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.29□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A087WX48 190 aa11.28□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 ELOBQ15370 118 aa11.28□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa11.28□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 BORCS7Q96B45 105 aa11.28□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 DNAJC30Q96LL9 226 aa11.28□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 DPH3P1Q9H4G8 78 aa11.28□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 KLK12Q9UKR0 248 aa11.28□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 UBR4Q5T4S7 5183 aa11.27□□□□□ -0.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 PKIAP61925 76 aa11.27□□□□□ -0.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 NIT1Q86X76 327 aa11.27□□□□□ -0.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 C15orf54Q8N8G6 183 aa11.27□□□□□ -0.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 UBE2WQ96B02 151 aa11.27□□□□□ -0.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 SMDT1Q9H4I9 107 aa11.27□□□□□ -0.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa11.26□□□□□ -0.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM262E9PQX1 116 aa11.26□□□□□ -0.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM241Q24JQ0 296 aa11.26□□□□□ -0.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 CT83Q5H943 113 aa11.26□□□□□ -0.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 LINC01551Q86U37 167 aa11.26□□□□□ -0.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 CHCHD7Q9BUK0 85 aa11.26□□□□□ -0.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 CNFNQ9BYD5 112 aa11.26□□□□□ -0.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAT3Q8TDW7 4589 aa11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms