RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560253.1

MEIS3-208, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 2

Gene MEIS3, Length 1,060 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-208ENST00000560253 DNAH17Q9UFH2 4485 aa10.05□□□□□ -0.8
MEIS3-208ENST00000560253 FAT2Q9NYQ8 4349 aa10.04□□□□□ -0.8
MEIS3-208ENST00000560253 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa10.04□□□□□ -0.8
MEIS3-208ENST00000560253 TMEM262E9PQX1 116 aa10.04□□□□□ -0.8
MEIS3-208ENST00000560253 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
MEIS3-208ENST00000560253 MGPP08493 103 aa10.04□□□□□ -0.8
MEIS3-208ENST00000560253 KRTAP10-2P60368 255 aa10.04□□□□□ -0.8
MEIS3-208ENST00000560253 LYZL1Q6UWQ5 148 aa10.04□□□□□ -0.8
MEIS3-208ENST00000560253 SMIM15Q7Z3B0 74 aa10.04□□□□□ -0.8
MEIS3-208ENST00000560253 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
MEIS3-208ENST00000560253 OCC1Q8TAD7 63 aa10.04□□□□□ -0.8
MEIS3-208ENST00000560253 DNAJC30Q96LL9 226 aa10.04□□□□□ -0.8
MEIS3-208ENST00000560253 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
MEIS3-208ENST00000560253 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
MEIS3-208ENST00000560253 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa10.03□□□□□ -0.8
MEIS3-208ENST00000560253 NIT1Q86X76 327 aa10.03□□□□□ -0.8
MEIS3-208ENST00000560253 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa10.03□□□□□ -0.8
MEIS3-208ENST00000560253 A0A1B0GVG6 124 aa10.02□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 GATCO43716 136 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 NTF3P20783 257 aa10.02□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 TWIST1Q15672 202 aa10.02□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 DPH3P1Q9H4G8 78 aa10.02□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 HSPG2P98160 4391 aa10.01□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 A8MWL6 223 aa10.01□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 Q0VG73 95 aa10.01□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 BORCS7Q96B45 105 aa10.01□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 FAM210AQ96ND0 272 aa10.01□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 SMIM7Q9BQ49 75 aa10.01□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa10.01□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 CHCHD5Q9BSY4 110 aa10□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 KLK12Q9UKR0 248 aa10□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.99□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 ZNF727A8MUV8 499 aa9.99□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 K7EN84 100 aa9.99□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 CRPP02741 224 aa9.99□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 RASL11AQ6T310 242 aa9.99□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.99□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 UBE2WQ96B02 151 aa9.99□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.98□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 GCSHP23434 173 aa9.98□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 CTRLP40313 264 aa9.98□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 NIT2Q9NQR4 276 aa9.98□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 UBR4Q5T4S7 5183 aa9.97□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa9.97□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 M0QY20 66 aa9.97□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.97□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 CT83Q5H943 113 aa9.97□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.97□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 TEX261Q6UWH6 196 aa9.97□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 FRZBQ92765 325 aa9.97□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 PKD1P98161 4303 aa9.96□□□□□ -0.81
MEIS3-208ENST00000560253 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.96□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.96□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 PEA15Q15121 130 aa9.96□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 Q8N3U1 123 aa9.96□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 Q8N814 137 aa9.96□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa9.96□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 C15orf54Q8N8G6 183 aa9.96□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 CNFNQ9BYD5 112 aa9.96□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 Q8N976 141 aa9.95□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.95□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.94□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 LINC01551Q86U37 167 aa9.94□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.94□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.94□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 OSTCQ9NRP0 149 aa9.94□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 FAM231BA6NCW3 169 aa9.93□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 UBE2L6O14933 153 aa9.93□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 COTL1Q14019 142 aa9.93□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 IQCJQ1A5X6 159 aa9.93□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.93□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 GAGE6Q13070 117 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 MIAQ16674 131 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 C14orf177Q52M58 125 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 MPV17L2Q567V2 206 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 ATRAIDQ6UW56 229 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 TSKUQ8WUA8 353 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 GTSF1Q8WW33 167 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 TMEM243Q9BU79 118 aa9.92□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 A0A1B0GUT8 65 aa9.91□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 BAALCQ8WXS3 180 aa9.91□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 LECT2O14960 151 aa9.9□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 AMTP48728 403 aa9.9□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 RBX1P62877 108 aa9.9□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 Q8N1X5 172 aa9.9□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 GATD1Q8NB37 220 aa9.9□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 NAT8Q9UHE5 227 aa9.9□□□□□ -0.82
MEIS3-208ENST00000560253 HIGD1CA8MV81 97 aa9.89□□□□□ -0.83
MEIS3-208ENST00000560253 KRTAP10-1P60331 282 aa9.89□□□□□ -0.83
MEIS3-208ENST00000560253 RAB14P61106 215 aa9.89□□□□□ -0.83
MEIS3-208ENST00000560253 RIGQ13278 110 aa9.89□□□□□ -0.83
MEIS3-208ENST00000560253 ADIRFQ15847 76 aa9.89□□□□□ -0.83
MEIS3-208ENST00000560253 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms