RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560246.1

FAM227B-210, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene FAM227B, Length 911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-210ENST00000560246 A0A087WWC5 75 aa9.26□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 RBFOX3A6NFN3 312 aa9.26□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 MGPP08493 103 aa9.26□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 RAB4BP61018 213 aa9.26□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.26□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 SMIM12Q96EX1 92 aa9.26□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa9.25□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 LINC00694P0DN24 101 aa9.25□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 KCNIP4Q6PIL6 250 aa9.25□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 AP1S3Q96PC3 154 aa9.25□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.24□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.24□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.24□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 Q8N3U1 123 aa9.24□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.24□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.23□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.23□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 CACNG7P62955 275 aa9.23□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.23□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 NUDT11Q96G61 164 aa9.23□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 TMEM262E9PQX1 116 aa9.22□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 FAM229AH3BQW9 127 aa9.22□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 UBE2D3P61077 147 aa9.22□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 UBE2D2P62837 147 aa9.22□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 TOR2AQ5JU69 321 aa9.22□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.22□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 Q8N814 137 aa9.22□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.22□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 OCC1Q8TAD7 63 aa9.22□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.22□□□□□ -0.93
FAM227B-210ENST00000560246 A0A087WX48 190 aa9.21□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 F2Z2F3 143 aa9.21□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 IGLC6P0CF74 106 aa9.21□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 TM2D2Q9BX73 214 aa9.21□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 TRGC1P0CF51 173 aa9.2□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 OR10G8Q8NGN5 311 aa9.2□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 KLK12Q9UKR0 248 aa9.2□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.19□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 TMEM250H0YL14 139 aa9.19□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 H7C1H1 209 aa9.19□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 K7EN84 100 aa9.19□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 NTF3P20783 257 aa9.19□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 LAGE3Q14657 143 aa9.19□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 TWIST1Q15672 202 aa9.19□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 NIT1Q86X76 327 aa9.19□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.19□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 WFDC2Q14508 124 aa9.18□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 ELOBQ15370 118 aa9.18□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 RMI2Q96E14 147 aa9.18□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.18□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa9.17□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.17□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.17□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 LYPD6BQ8NI32 183 aa9.17□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 UBE2WQ96B02 151 aa9.17□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.17□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.17□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 ZNF727A8MUV8 499 aa9.16□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 CRPP02741 224 aa9.16□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.16□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.16□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.16□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 FAM210AQ96ND0 272 aa9.16□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 LECT2O14960 151 aa9.15□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 RASL11AQ6T310 242 aa9.15□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 Q6ZSA8 131 aa9.15□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 C15orf54Q8N8G6 183 aa9.15□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 BORCS7Q96B45 105 aa9.15□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.15□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 COX11Q9Y6N1 276 aa9.15□□□□□ -0.94
FAM227B-210ENST00000560246 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.14□□□□□ -0.95
FAM227B-210ENST00000560246 A8MWL6 223 aa9.14□□□□□ -0.95
FAM227B-210ENST00000560246 M0QY20 66 aa9.14□□□□□ -0.95
FAM227B-210ENST00000560246 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
FAM227B-210ENST00000560246 CTRLP40313 264 aa9.14□□□□□ -0.95
FAM227B-210ENST00000560246 GAGE6Q13070 117 aa9.14□□□□□ -0.95
FAM227B-210ENST00000560246 WDR73Q6P4I2 378 aa9.14□□□□□ -0.95
FAM227B-210ENST00000560246 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.14□□□□□ -0.95
FAM227B-210ENST00000560246 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
FAM227B-210ENST00000560246 PKIAP61925 76 aa9.13□□□□□ -0.95
FAM227B-210ENST00000560246 Q0VG73 95 aa9.13□□□□□ -0.95
FAM227B-210ENST00000560246 MPV17L2Q567V2 206 aa9.13□□□□□ -0.95
FAM227B-210ENST00000560246 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.13□□□□□ -0.95
FAM227B-210ENST00000560246 BAALCQ8WXS3 180 aa9.13□□□□□ -0.95
FAM227B-210ENST00000560246 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
FAM227B-210ENST00000560246 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.12□□□□□ -0.95
FAM227B-210ENST00000560246 ATRAIDQ6UW56 229 aa9.12□□□□□ -0.95
FAM227B-210ENST00000560246 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.12□□□□□ -0.95
FAM227B-210ENST00000560246 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.12□□□□□ -0.95
FAM227B-210ENST00000560246 Q8N976 141 aa9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms