RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.34□□□□□ -1.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.34□□□□□ -1.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 Q9HAA7 133 aa8.34□□□□□ -1.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 LAGE3Q14657 143 aa8.33□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 LINC01551Q86U37 167 aa8.33□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 Q8N3U1 123 aa8.33□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.33□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 A0A087WTM6 91 aa8.32□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 A0A087WX48 190 aa8.32□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.32□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 M0QY20 66 aa8.32□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 KRTAP10-2P60368 255 aa8.32□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 PEA15Q15121 130 aa8.32□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.32□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.32□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.32□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 NIT1Q86X76 327 aa8.32□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 GTSF1Q8WW33 167 aa8.32□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.32□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CNFNQ9BYD5 112 aa8.32□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.32□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM262E9PQX1 116 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CT83Q5H943 113 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 TM2D2Q9BX73 214 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ELOBQ15370 118 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 RASL11AQ6T310 242 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 BORCS7Q96B45 105 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 OSTCQ9NRP0 149 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.29□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 C9JQL5 133 aa8.29□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 PKIAP61925 76 aa8.29□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 TSKUQ8WUA8 353 aa8.29□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.29□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.29□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 KLK12Q9UKR0 248 aa8.29□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 PKD1P98161 4303 aa8.28□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.28□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 RMI2Q96E14 147 aa8.28□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.28□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 NIT2Q9NQR4 276 aa8.28□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 COX11Q9Y6N1 276 aa8.28□□□□□ -1.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 PKHD1P08F94 4074 aa8.27□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.27□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM231BA6NCW3 169 aa8.27□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 HIGD1CA8MV81 97 aa8.27□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 RAB14P61106 215 aa8.27□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 ADIRFQ15847 76 aa8.27□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.27□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 ISOC2Q96AB3 205 aa8.27□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 UBE2WQ96B02 151 aa8.27□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 NAT8Q9UHE5 227 aa8.27□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 HERC2O95714 4834 aa8.27□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.26□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 A0A1B0GUT8 65 aa8.26□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.26□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 Q0VG73 95 aa8.26□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 GATD1Q8NB37 220 aa8.26□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 FRZBQ92765 325 aa8.26□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.25□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.25□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 CDK2AP2O75956 126 aa8.25□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 GAGE6Q13070 117 aa8.25□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 IQCJQ1A5X6 159 aa8.25□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 MPV17L2Q567V2 206 aa8.25□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 V9GYV3 84 aa8.25□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 CRPP02741 224 aa8.24□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 RIGQ13278 110 aa8.24□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 COTL1Q14019 142 aa8.24□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.24□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 Q8N814 137 aa8.24□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM243Q9BU79 118 aa8.24□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 RBX1P62877 108 aa8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 Q8N976 141 aa8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 GCSHP23434 173 aa8.22□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 AMTP48728 403 aa8.22□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 ENHOQ6UWT2 76 aa8.22□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 NUP35Q8NFH5 326 aa8.22□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.22□□□□□ -1.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 BAALCQ8WXS3 180 aa8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms