RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 EREGO14944 169 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 ADIRFQ15847 76 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 MSRB1Q9NZV6 116 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 DNAH17Q9UFH2 4485 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 LINC00315P59091 139 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 LAGE3Q14657 143 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 ELOBQ15370 118 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 ISOC2Q96AB3 205 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A1B0GUT8 65 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 RPL23P62829 140 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 CLLU1Q5K131 121 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 RASL11AQ6T310 242 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 GTSF1Q8WW33 167 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 HIGD1CA8MV81 97 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 PGLYRP4Q96LB8 373 aa10.73□□□□□ -0.69
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RABGGTA-205ENST00000558534 A0A087WX48 190 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 M0QY20 66 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 RIGQ13278 110 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 SUMO4Q6EEV6 95 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 NIT2Q9NQR4 276 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 PPP1R2P9O14990 202 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 RMI2Q96E14 147 aa10.71□□□□□ -0.69
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RABGGTA-205ENST00000558534 COX11Q9Y6N1 276 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 V9GYV3 84 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTA-205ENST00000558534 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A1B0GVY2 172 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A1B0GW15 77 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 PSCAO43653 123 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 UQCC3Q6UW78 93 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 C9JQL5 133 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 IGHV3-30P01768 117 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 IGHV3-33P01772 117 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 S100A8P05109 93 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 TNP2Q05952 138 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 NIT1Q86X76 327 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM191AQ9H0A3 160 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 Q9UF83 564 aa10.69□□□□□ -0.7
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RABGGTA-205ENST00000558534 PPP1R17O96001 155 aa10.68□□□□□ -0.7
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RABGGTA-205ENST00000558534 Q0VG73 95 aa10.67□□□□□ -0.7
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RABGGTA-205ENST00000558534 CHCHD5Q9BSY4 110 aa10.67□□□□□ -0.7
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RABGGTA-205ENST00000558534 ANAPC16Q96DE5 110 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 MRAP2Q96G30 205 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 CRPP02741 224 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 MT-ND4LP03901 98 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 COTL1Q14019 142 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 IQCJQ1A5X6 159 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTA-205ENST00000558534 UBE2L6O14933 153 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 NCR2O95944 276 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 GATD1Q8NB37 220 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 Q9HAA7 133 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 PKD1P98161 4303 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 F8W036 122 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 CDPF1Q6NVV7 123 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM243Q9BU79 118 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 IFITM2Q01629 132 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 ST20Q9HBF5 79 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 AMTP48728 403 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 HBBP68871 147 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 KLK12Q9UKR0 248 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 PKHD1P08F94 4074 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 LINC00862A6NCI5 91 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 SDHAF1A6NFY7 115 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 C16orf90A8MZG2 172 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 H7C423 109 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 ANGP03950 147 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 RAB4AP20338 218 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 SPATA12Q7Z6I5 190 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A087WTM6 91 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 I3L3M4 83 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 APCSP02743 223 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 SMAGPQ0VAQ4 97 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 MIAQ16674 131 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 MPV17L2Q567V2 206 aa10.59□□□□□ -0.71
RABGGTA-205ENST00000558534 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa10.59□□□□□ -0.71
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