RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa15.61■□□□□ 0.09
TMEM260-216ENST00000557657 SAMD5Q5TGI4 173 aa15.61■□□□□ 0.09
TMEM260-216ENST00000557657 KIR2DL4Q99706 377 aa15.61■□□□□ 0.09
TMEM260-216ENST00000557657 MTORP42345 2549 aa15.61■□□□□ 0.09
TMEM260-216ENST00000557657 SAP30O75446 220 aa15.61■□□□□ 0.09
TMEM260-216ENST00000557657 OCIAD2Q56VL3 154 aa15.61■□□□□ 0.09
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM61Q8N0U2 210 aa15.61■□□□□ 0.09
TMEM260-216ENST00000557657 PLEKHB2Q96CS7 222 aa15.61■□□□□ 0.09
TMEM260-216ENST00000557657 TM2D2Q9BX73 214 aa15.61■□□□□ 0.09
TMEM260-216ENST00000557657 Q9UF83 564 aa15.61■□□□□ 0.09
TMEM260-216ENST00000557657 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa15.6■□□□□ 0.09
TMEM260-216ENST00000557657 FOXI2Q6ZQN5 318 aa15.6■□□□□ 0.09
TMEM260-216ENST00000557657 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa15.6■□□□□ 0.09
TMEM260-216ENST00000557657 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TMEM260-216ENST00000557657 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa15.58■□□□□ 0.09
TMEM260-216ENST00000557657 RNF152Q8N8N0 203 aa15.58■□□□□ 0.09
TMEM260-216ENST00000557657 JMJD1CQ15652 2540 aa15.58■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa15.58■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 SYT8Q8NBV8 401 aa15.58■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa15.57■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 E9PLD3 99 aa15.57■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 ZNRF2Q8NHG8 242 aa15.57■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 CBY1Q9Y3M2 126 aa15.57■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF815PA8K554 130 aa15.56■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 WFDC11Q8NEX6 87 aa15.56■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 FABP2P12104 132 aa15.56■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 ITPR2Q14571 2701 aa15.56■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 LINC01619G3V211 115 aa15.55■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 C12orf74Q32Q52 190 aa15.55■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 H3BMM0 161 aa15.55■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 TSPEAR-AS2P59090 65 aa15.55■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 RPL32P62910 135 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 PMVKQ15126 192 aa15.55■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 A0A1W2PRX2 142 aa15.54■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa15.54■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM170BQ5T4T1 132 aa15.54■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 SCGB2A2Q13296 93 aa15.53■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 RIPPLY3P57055 190 aa15.52■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 SCGB1D4Q6XE38 83 aa15.52■□□□□ 0.08
TMEM260-216ENST00000557657 IGLL5B9A064 214 aa15.52■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 Q6ZSN1 163 aa15.52■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 Q8N2B8 174 aa15.52■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 NACAE9PAV3 2078 aa15.51■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 TRGV11A0A075B6L2 103 aa15.5■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa15.5■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 MAP6D1Q9H9H5 199 aa15.5■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 PCP4P48539 62 aa15.5■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 Q6ZSV7 163 aa15.5■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 MTURNQ8N3F0 131 aa15.5■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 TIMM17AQ99595 171 aa15.5■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 DYNLRB2Q8TF09 96 aa15.49■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 SFTA2Q6UW10 78 aa15.49■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 C4orf3Q8WVX3 66 aa15.49■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM141Q96I45 108 aa15.49■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 VPS25Q9BRG1 176 aa15.49■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF479Q96JC4 524 aa15.48■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 TAL2Q16559 108 aa15.48■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 PDZD2O15018 2839 aa15.48■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 C20orf203Q8NBC4 194 aa15.47■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 ESM1Q9NQ30 184 aa15.47■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 C2CD3Q4AC94 2353 aa15.47■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 I3L3M4 83 aa15.46■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 DEFB114Q30KQ6 69 aa15.46■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa15.46■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 PEMTQ9UBM1 199 aa15.46■□□□□ 0.07
TMEM260-216ENST00000557657 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa15.45■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa15.45■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 OR5A1Q8NGJ0 315 aa15.45■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 LINC01587Q99440 93 aa15.45■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 XCL2Q9UBD3 114 aa15.45■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa15.44■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 A0A0J9YXV3 536 aa15.44■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 H3BMG7 143 aa15.44■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 RAX2Q96IS3 184 aa15.44■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 CD28P10747 220 aa15.44■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa15.43■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa15.43■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 A0A0J9YY99 117 aa15.43■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 AZU1P20160 251 aa15.43■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 FAM104AQ969W3 186 aa15.43■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 RHOHQ15669 191 aa15.42■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 HERVK_113P61574 105 aa15.42■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 AMELXQ99217 191 aa15.42■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 A8MTW9 85 aa15.41■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 K7ERU9 68 aa15.41■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 RRN3P1Q2M238 152 aa15.41■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 ODF3L2Q3SX64 289 aa15.41■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 M0R2P5 195 aa15.41■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 APOMO95445 188 aa15.41■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa15.41■□□□□ 0.06
TMEM260-216ENST00000557657 WFDC2Q14508 124 aa15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms